RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 METRNQ9UJH8 293 aa15.83■□□□□ 0.12
CTXN3-204ENST00000620385 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CTXN3-204ENST00000620385 POTEMA6NI47 508 aa15.79■□□□□ 0.12
CTXN3-204ENST00000620385 POTEJP0CG39 1038 aa15.79■□□□□ 0.12
CTXN3-204ENST00000620385 PROM2Q8N271 834 aa15.77■□□□□ 0.12
CTXN3-204ENST00000620385 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CTXN3-204ENST00000620385 SLC39A7Q92504 469 aa15.76■□□□□ 0.11
CTXN3-204ENST00000620385 C7P10643 843 aa15.75■□□□□ 0.11
CTXN3-204ENST00000620385 POTEGQ6S5H5 508 aa15.74■□□□□ 0.11
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.73■□□□□ 0.11
CTXN3-204ENST00000620385 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
CTXN3-204ENST00000620385 KIF12Q96FN5 646 aa15.65■□□□□ 0.1
CTXN3-204ENST00000620385 TRPC6Q9Y210 931 aa15.61■□□□□ 0.09
CTXN3-204ENST00000620385 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.6■□□□□ 0.09
CTXN3-204ENST00000620385 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CTXN3-204ENST00000620385 POTEFA5A3E0 1075 aa15.57■□□□□ 0.08
CTXN3-204ENST00000620385 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
CTXN3-204ENST00000620385 MAP3K13O43283 966 aa15.54■□□□□ 0.08
CTXN3-204ENST00000620385 RASEFQ8IZ41 740 aa15.54■□□□□ 0.08
CTXN3-204ENST00000620385 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.52■□□□□ 0.08
CTXN3-204ENST00000620385 MIER1Q8N108 512 aa15.49■□□□□ 0.07
CTXN3-204ENST00000620385 TIE1P35590 1138 aa15.48■□□□□ 0.07
CTXN3-204ENST00000620385 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CTXN3-204ENST00000620385 PCDH10Q9P2E7 1040 aa15.48■□□□□ 0.07
CTXN3-204ENST00000620385 PLEKHG5O94827 1062 aa15.45■□□□□ 0.06
CTXN3-204ENST00000620385 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.42■□□□□ 0.06
CTXN3-204ENST00000620385 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CTXN3-204ENST00000620385 SEC24BO95487 1268 aa15.34■□□□□ 0.05
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.32■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.31■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.31■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.28■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 NUBP1P53384 320 aa15.27■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 IER5LQ5T953 404 aa15.27■□□□□ 0.04
CTXN3-204ENST00000620385 IFNL1Q8IU54 200 aa15.24■□□□□ 0.03
CTXN3-204ENST00000620385 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.17■□□□□ 0.02
CTXN3-204ENST00000620385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.16■□□□□ 0.02
CTXN3-204ENST00000620385 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.14■□□□□ 0.01
CTXN3-204ENST00000620385 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.14■□□□□ 0.01
CTXN3-204ENST00000620385 FAM212AQ96EL1 285 aa15.14■□□□□ 0.01
CTXN3-204ENST00000620385 ST18O60284 1047 aa15.09■□□□□ 0.01
CTXN3-204ENST00000620385 PLCG2P16885 1265 aa15.09■□□□□ 0.01
CTXN3-204ENST00000620385 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CTXN3-204ENST00000620385 PYGBP11216 843 aa14.98□□□□□ -0.01
CTXN3-204ENST00000620385 FKBP8Q14318 412 aa14.98□□□□□ -0.01
CTXN3-204ENST00000620385 OCEL1Q9H607 264 aa14.96□□□□□ -0.01
CTXN3-204ENST00000620385 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.95□□□□□ -0.02
CTXN3-204ENST00000620385 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.94□□□□□ -0.02
CTXN3-204ENST00000620385 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.93□□□□□ -0.02
CTXN3-204ENST00000620385 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CTXN3-204ENST00000620385 MARVELD3Q96A59 401 aa14.82□□□□□ -0.04
CTXN3-204ENST00000620385 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
CTXN3-204ENST00000620385 SNPHO15079 494 aa14.8□□□□□ -0.04
CTXN3-204ENST00000620385 MMRN1Q13201 1228 aa14.79□□□□□ -0.04
CTXN3-204ENST00000620385 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.79□□□□□ -0.04
CTXN3-204ENST00000620385 FBXO3Q9UK99 471 aa14.74□□□□□ -0.05
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CTXN3-204ENST00000620385 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.7□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 GSE1Q14687 1217 aa14.68□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 GOLGA2Q08379 1002 aa14.67□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 NACADO15069 1562 aa14.67□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 KLHL34Q8N239 644 aa14.66□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
CTXN3-204ENST00000620385 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 EMP3P54852 163 aa14.64□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 PSEN1P49768 467 aa14.62□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 POTEB3A0JP26 581 aa14.61□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 POTEBQ6S5H4 581 aa14.61□□□□□ -0.07
CTXN3-204ENST00000620385 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.57□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.57□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.56□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.55□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 FAM205CA6NFA0 338 aa14.54□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa14.53□□□□□ -0.08
CTXN3-204ENST00000620385 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CTXN3-204ENST00000620385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.48□□□□□ -0.09
CTXN3-204ENST00000620385 CABP2Q9NPB3 220 aa14.46□□□□□ -0.09
CTXN3-204ENST00000620385 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC9O60706 1549 aa14.44□□□□□ -0.1
CTXN3-204ENST00000620385 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.43□□□□□ -0.1
CTXN3-204ENST00000620385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.41□□□□□ -0.1
CTXN3-204ENST00000620385 SCRIBQ14160 1630 aa14.39□□□□□ -0.11
CTXN3-204ENST00000620385 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
CTXN3-204ENST00000620385 G3V3G9 751 aa14.37□□□□□ -0.11
CTXN3-204ENST00000620385 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
CTXN3-204ENST00000620385 SPOCK2Q92563 424 aa14.36□□□□□ -0.11
CTXN3-204ENST00000620385 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CTXN3-204ENST00000620385 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.31□□□□□ -0.12
CTXN3-204ENST00000620385 ERBB3P21860 1342 aa14.27□□□□□ -0.12
CTXN3-204ENST00000620385 DOK7Q18PE1 504 aa14.27□□□□□ -0.13
CTXN3-204ENST00000620385 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.25□□□□□ -0.13
CTXN3-204ENST00000620385 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
CTXN3-204ENST00000620385 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms