RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615025.4

TNS1-221, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-221ENST00000615025 CLIP1P30622 1438 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-221ENST00000615025 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 FKBP8Q14318 412 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 ERCC6Q03468 1493 aa14.63□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 MRS2Q9HD23 443 aa14.59□□□□□ -0.07
TNS1-221ENST00000615025 NACADO15069 1562 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 RGL3Q3MIN7 710 aa14.56□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 ARXQ96QS3 562 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.081e-8■■■■■ 49.3
TNS1-221ENST00000615025 GOLGA3Q08378 1498 aa14.55□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.54□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 EEA1Q15075 1411 aa14.52□□□□□ -0.08
TNS1-221ENST00000615025 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TNS1-221ENST00000615025 KIF27Q86VH2 1401 aa14.52□□□□□ -0.09
TNS1-221ENST00000615025 NBR1Q14596 966 aa14.49□□□□□ -0.09
TNS1-221ENST00000615025 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TNS1-221ENST00000615025 CFAP53Q96M91 514 aa14.47□□□□□ -0.09
TNS1-221ENST00000615025 CDCA8Q53HL2 280 aa14.47□□□□□ -0.09
TNS1-221ENST00000615025 CEP162Q5TB80 1403 aa14.46□□□□□ -0.1
TNS1-221ENST00000615025 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
TNS1-221ENST00000615025 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.43□□□□□ -0.1
TNS1-221ENST00000615025 LMOD2Q6P5Q4 547 aa14.42□□□□□ -0.1
TNS1-221ENST00000615025 POGKQ9P215 609 aa14.42□□□□□ -0.1
TNS1-221ENST00000615025 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.4□□□□□ -0.1
TNS1-221ENST00000615025 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.39□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.36□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.34□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 MLECQ14165 292 aa14.33□□□□□ -0.11
TNS1-221ENST00000615025 KANK1Q14678 1352 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 NUDCQ9Y266 331 aa14.33□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 TNIKQ9UKE5 1360 aa14.32□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 MIER1Q8N108 512 aa14.32□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 NPHP1O15259 732 aa14.31□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 HDGFP51858 240 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 NEUROD2Q15784 382 aa14.3□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 CASC1Q6TDU7 716 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 CUX2O14529 1486 aa14.28□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.27□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.27□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.27□□□□□ -0.12
TNS1-221ENST00000615025 BECN1Q14457 450 aa14.27□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 GOLGA6L22H0YM25 854 aa14.24□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.22□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 TMF1P82094 1093 aa14.21□□□□□ -0.13
TNS1-221ENST00000615025 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.21□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.2□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 GGT6Q6P531 493 aa14.2□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 SOX12O15370 315 aa14.19□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.18□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.17□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 GOLGA2Q08379 1002 aa14.15□□□□□ -0.14
TNS1-221ENST00000615025 STK26Q9P289 416 aa14.13□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 MS4A1P11836 297 aa14.12□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 MORC1Q86VD1 984 aa14.12□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 SOGA1O94964 1423 aa14.11□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.11□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 SMARCA2P51531 1590 aa14.11□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.1□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.1□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
TNS1-221ENST00000615025 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.08□□□□□ -0.16
TNS1-221ENST00000615025 FGD1P98174 961 aa14.08□□□□□ -0.16
TNS1-221ENST00000615025 PKD2Q13563 968 aa14.08□□□□□ -0.16
TNS1-221ENST00000615025 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.08□□□□□ -0.16
TNS1-221ENST00000615025 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
TNS1-221ENST00000615025 KCNJ4P48050 445 aa14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms