RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 PLEKHG5O94827 1062 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-207ENST00000613246 PLCB2Q00722 1185 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB7CA1YPR0 619 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-207ENST00000613246 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-207ENST00000613246 CASC1Q6TDU7 716 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRJ-207ENST00000613246 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-207ENST00000613246 C14orf37Q86TY3 774 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CLSTN1O94985 981 aa24.35■■□□□ 1.49
PTPRJ-207ENST00000613246 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-207ENST00000613246 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-207ENST00000613246 MRS2Q9HD23 443 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NRDCO43847 1150 aa24.3■■□□□ 1.48
PTPRJ-207ENST00000613246 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-207ENST00000613246 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 NPHP1O15259 732 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 FGD1P98174 961 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 DRC7Q8IY82 874 aa24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PTPRJ-207ENST00000613246 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
PTPRJ-207ENST00000613246 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PTPRJ-207ENST00000613246 PRM3Q9NNZ6 103 aa24.17■■□□□ 1.46
PTPRJ-207ENST00000613246 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-207ENST00000613246 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
PTPRJ-207ENST00000613246 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PTPRJ-207ENST00000613246 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PTPRJ-207ENST00000613246 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PTPRJ-207ENST00000613246 KCNJ4P48050 445 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA2012Q0VF49 1180 aa24.1■■□□□ 1.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA2Q08379 1002 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa24.09■■□□□ 1.45
PTPRJ-207ENST00000613246 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PTPRJ-207ENST00000613246 ARID3AQ99856 593 aa24.05■■□□□ 1.44
PTPRJ-207ENST00000613246 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-207ENST00000613246 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
PTPRJ-207ENST00000613246 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.03■■□□□ 1.44
PTPRJ-207ENST00000613246 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPRJ-207ENST00000613246 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.01■■□□□ 1.43
PTPRJ-207ENST00000613246 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24■■□□□ 1.43
PTPRJ-207ENST00000613246 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
PTPRJ-207ENST00000613246 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PTPRJ-207ENST00000613246 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 RGS3P49796 1198 aa23.93■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP53Q96M91 514 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 HSCBQ8IWL3 235 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.89■■□□□ 1.42
PTPRJ-207ENST00000613246 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRJ-207ENST00000613246 MIER1Q8N108 512 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRJ-207ENST00000613246 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRJ-207ENST00000613246 PDE4CQ08493 712 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRJ-207ENST00000613246 NEUROD2Q15784 382 aa23.84■■□□□ 1.41
PTPRJ-207ENST00000613246 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
PTPRJ-207ENST00000613246 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.49e-7■■■■□ 24.4
PTPRJ-207ENST00000613246 MCCP23508 829 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRJ-207ENST00000613246 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRJ-207ENST00000613246 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRJ-207ENST00000613246 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPY4P0CV99 314 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRJ-207ENST00000613246 TSPY10P0CW01 314 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRJ-207ENST00000613246 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRJ-207ENST00000613246 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRJ-207ENST00000613246 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRJ-207ENST00000613246 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 RGL3Q3MIN7 710 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 TPM4P67936 248 aa23.64■■□□□ 1.38
PTPRJ-207ENST00000613246 MS4A1P11836 297 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 FBXO3Q9UK99 471 aa23.63■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 USP35Q9P2H5 1018 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 NUDCQ9Y266 331 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 CDCA8Q53HL2 280 aa23.62■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.61■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.58■■□□□ 1.37
PTPRJ-207ENST00000613246 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 PTMSP20962 102 aa23.57■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 CEP89Q96ST8 783 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 GBP4Q96PP9 640 aa23.56■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.54■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 ABCC9O60706 1549 aa23.53■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 CFAP44Q96MT7 982 aa23.52■■□□□ 1.36
PTPRJ-207ENST00000613246 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PTPRJ-207ENST00000613246 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PTPRJ-207ENST00000613246 APBB1O00213 710 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-207ENST00000613246 POGKQ9P215 609 aa23.48■■□□□ 1.35
PTPRJ-207ENST00000613246 RASSF8Q8NHQ8 419 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRJ-207ENST00000613246 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.44■■□□□ 1.34
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