RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 ERCC6Q03468 1493 aa27.03■■□□□ 1.92
CTDP1-208ENST00000613122 FKBP8Q14318 412 aa27.01■■□□□ 1.91
CTDP1-208ENST00000613122 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.97■■□□□ 1.91
CTDP1-208ENST00000613122 MRS2Q9HD23 443 aa26.96■■□□□ 1.91
CTDP1-208ENST00000613122 NACADO15069 1562 aa26.95■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 EEA1Q15075 1411 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA3Q08378 1498 aa26.91■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 RGL3Q3MIN7 710 aa26.89■■□□□ 1.9
CTDP1-208ENST00000613122 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.892e-8■■■■■ 75.2
CTDP1-208ENST00000613122 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.88■■□□□ 1.89
CTDP1-208ENST00000613122 KIF27Q86VH2 1401 aa26.87■■□□□ 1.89
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.84■■□□□ 1.89
CTDP1-208ENST00000613122 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
CTDP1-208ENST00000613122 CDCA8Q53HL2 280 aa26.76■■□□□ 1.87
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP53Q96M91 514 aa26.75■■□□□ 1.87
CTDP1-208ENST00000613122 CEP162Q5TB80 1403 aa26.73■■□□□ 1.87
CTDP1-208ENST00000613122 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
CTDP1-208ENST00000613122 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
CTDP1-208ENST00000613122 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.67■■□□□ 1.86
CTDP1-208ENST00000613122 POGKQ9P215 609 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDP1-208ENST00000613122 ARXQ96QS3 562 aa26.65■■□□□ 1.86
CTDP1-208ENST00000613122 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.64■■□□□ 1.86
CTDP1-208ENST00000613122 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.63■■□□□ 1.85
CTDP1-208ENST00000613122 CARD11Q9BXL7 1154 aa26.62■■□□□ 1.85
CTDP1-208ENST00000613122 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.56■■□□□ 1.84
CTDP1-208ENST00000613122 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDP1-208ENST00000613122 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
CTDP1-208ENST00000613122 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.52■■□□□ 1.84
CTDP1-208ENST00000613122 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDP1-208ENST00000613122 KANK1Q14678 1352 aa26.5■■□□□ 1.83
CTDP1-208ENST00000613122 NUDCQ9Y266 331 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDP1-208ENST00000613122 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
CTDP1-208ENST00000613122 MLECQ14165 292 aa26.49■■□□□ 1.83
CTDP1-208ENST00000613122 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
CTDP1-208ENST00000613122 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 MIER1Q8N108 512 aa26.44■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 CUX2O14529 1486 aa26.42■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 NPHP1O15259 732 aa26.41■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 NEUROD2Q15784 382 aa26.4■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CTDP1-208ENST00000613122 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CTDP1-208ENST00000613122 CASC1Q6TDU7 716 aa26.33■■□□□ 1.81
CTDP1-208ENST00000613122 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 BECN1Q14457 450 aa26.32■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa26.31■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 NBR1Q14596 966 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 TMF1P82094 1093 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 GGT6Q6P531 493 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 SIN3AQ96ST3 1273 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDP1-208ENST00000613122 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.26■■□□□ 1.79
CTDP1-208ENST00000613122 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
CTDP1-208ENST00000613122 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDP1-208ENST00000613122 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
CTDP1-208ENST00000613122 DDRGK1Q96HY6 314 aa26.23■■□□□ 1.79
CTDP1-208ENST00000613122 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.2■■□□□ 1.79
CTDP1-208ENST00000613122 SOX12O15370 315 aa26.19■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.18■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CTDP1-208ENST00000613122 MS4A1P11836 297 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 SOGA1O94964 1423 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 GOLGA2Q08379 1002 aa26.11■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 SMARCA2P51531 1590 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 STK26Q9P289 416 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 MORC1Q86VD1 984 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDP1-208ENST00000613122 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 PKD2Q13563 968 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.04■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
CTDP1-208ENST00000613122 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 FGD1P98174 961 aa26■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.99■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 KCNJ4P48050 445 aa25.98■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 RGS3P49796 1198 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.95■■□□□ 1.75
CTDP1-208ENST00000613122 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDP1-208ENST00000613122 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.95■■□□□ 1.74
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