RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606892.1

TRAF3IP2-AS1-211, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 730 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NUBP1P53384 320 aa16.39■□□□□ 0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CCDC61Q9Y6R9 512 aa16.38■□□□□ 0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KLHL34Q8N239 644 aa16.34■□□□□ 0.21
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ABCC9O60706 1549 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FAM212AQ96EL1 285 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DCBLD2Q96PD2 775 aa16.32■□□□□ 0.2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KIF12Q96FN5 646 aa16.26■□□□□ 0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POTEIP0CG38 1075 aa16.25■□□□□ 0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.23■□□□□ 0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.2■□□□□ 0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MAP3K13O43283 966 aa16.17■□□□□ 0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.16■□□□□ 0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPOCK2Q92563 424 aa16.15■□□□□ 0.18
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GSE1Q14687 1217 aa16.14■□□□□ 0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.09■□□□□ 0.17
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PYGBP11216 843 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TIE1P35590 1138 aa16.02■□□□□ 0.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 LHX8Q68G74 356 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 IFNL1Q8IU54 200 aa15.99■□□□□ 0.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TRPC6Q9Y210 931 aa15.97■□□□□ 0.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SLC39A7Q92504 469 aa15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 C7P10643 843 aa15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.91■□□□□ 0.14
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 METRNQ9UJH8 293 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TRIM41Q8WV44 630 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 IER5LQ5T953 404 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POTEB2H3BUK9 544 aa15.71■□□□□ 0.11
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SEC24BO95487 1268 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa15.68■□□□□ 0.1
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PSEN1P49768 467 aa15.68■□□□□ 0.1
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POTEFA5A3E0 1075 aa15.64■□□□□ 0.09
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GOLGA2Q08379 1002 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NACADO15069 1562 aa15.61■□□□□ 0.09
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 OTUD5Q96G74 571 aa15.6■□□□□ 0.09
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PLCG2P16885 1265 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POTEJP0CG39 1038 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 OCEL1Q9H607 264 aa15.55■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.53■□□□□ 0.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CABP2Q9NPB3 220 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PKD2Q13563 968 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.43■□□□□ 0.06
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DCAF8L2P0C7V8 631 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.33■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RGL2O15211 777 aa15.31■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.3■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SOX12O15370 315 aa15.28■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.27■□□□□ 0.04
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 STK25O00506 426 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 STK24Q9Y6E0 443 aa15.24■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.23■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.22■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 G3V3G9 751 aa15.21■□□□□ 0.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 BOLA1Q9Y3E2 137 aa15.19■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NLRP6P59044 892 aa15.15■□□□□ 0.02
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.14■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.1■□□□□ 0.01
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.08■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SNPHO15079 494 aa15.07■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.07■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MFRPQ9BY79 579 aa15.06■□□□□ 0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.05■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MICALL2Q8IY33 904 aa15.04■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SCRIBQ14160 1630 aa15.03■□□□□ -0
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms