RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586548.5

CIRBP-208, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 3

Gene CIRBP, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-208	ENST00000586548	ADAMTS12	P58397	1594 aa		34.44	■■■■□ 3.1
CIRBP-208	ENST00000586548	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		34.43	■■■■□ 3.1
CIRBP-208	ENST00000586548	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	34.43	■■■■□ 3.1
CIRBP-208	ENST00000586548	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		34.41	■■■■□ 3.1
CIRBP-208	ENST00000586548	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	34.36	■■■■□ 3.09
CIRBP-208	ENST00000586548	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	34.36	■■■■□ 3.09
CIRBP-208	ENST00000586548	SAMD9	Q5K651	1589 aa		34.22	■■■■□ 3.07
CIRBP-208	ENST00000586548	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIRBP-208	ENST00000586548	MAP3K1	Q13233	1512 aa		34.19	■■■■□ 3.06
CIRBP-208	ENST00000586548	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		34.17	■■■■□ 3.06
CIRBP-208	ENST00000586548	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	34.16	■■■■□ 3.06
CIRBP-208	ENST00000586548	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	34.13	■■■■□ 3.05
CIRBP-208	ENST00000586548	IQGAP2	Q13576	1575 aa		34.12	■■■■□ 3.05
CIRBP-208	ENST00000586548	TIAM1	Q13009	1591 aa		34.11	■■■■□ 3.05
CIRBP-208	ENST00000586548	P3H3	Q8IVL6	736 aa		34.1	■■■■□ 3.05
CIRBP-208	ENST00000586548	FMN1	Q68DA7	1419 aa		34.08	■■■■□ 3.05
CIRBP-208	ENST00000586548	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		34.07	■■■■□ 3.05
CIRBP-208	ENST00000586548	GRIN2A	Q12879	1464 aa		34.06	■■■■□ 3.04
CIRBP-208	ENST00000586548	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	34.06	■■■■□ 3.04
CIRBP-208	ENST00000586548	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		34.05	■■■■□ 3.04
CIRBP-208	ENST00000586548	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		34.04	■■■■□ 3.04
CIRBP-208	ENST00000586548	SYNJ2	O15056	1496 aa		34.02	■■■■□ 3.04
CIRBP-208	ENST00000586548	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		33.98	■■■■□ 3.03
CIRBP-208	ENST00000586548	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CIRBP-208	ENST00000586548	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.92	■■■■□ 3.02
CIRBP-208	ENST00000586548	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
CIRBP-208	ENST00000586548	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	33.87	■■■■□ 3.01
CIRBP-208	ENST00000586548	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	33.85	■■■■□ 3.01
CIRBP-208	ENST00000586548	CEP170	Q5SW79	1584 aa		33.84	■■■■□ 3.01
CIRBP-208	ENST00000586548	NUP160	Q12769	1436 aa		33.8	■■■■□ 3
CIRBP-208	ENST00000586548	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	33.79	■■■■□ 3
CIRBP-208	ENST00000586548	KIAA0556	O60303	1618 aa		33.78	■■■■□ 3
CIRBP-208	ENST00000586548	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		33.75	■■■□□ 2.99
CIRBP-208	ENST00000586548	DISP1	Q96F81	1524 aa		33.74	■■■□□ 2.99
CIRBP-208	ENST00000586548	FBLN2	P98095	1184 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CIRBP-208	ENST00000586548	HECW1	Q76N89	1606 aa		33.71	■■■□□ 2.99
CIRBP-208	ENST00000586548	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	33.7	■■■□□ 2.99
CIRBP-208	ENST00000586548	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	33.7	■■■□□ 2.98
CIRBP-208	ENST00000586548	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.69	■■■□□ 2.98
CIRBP-208	ENST00000586548	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		33.67	■■■□□ 2.98
CIRBP-208	ENST00000586548	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	33.65	■■■□□ 2.98
CIRBP-208	ENST00000586548	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CIRBP-208	ENST00000586548	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CIRBP-208	ENST00000586548	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CIRBP-208	ENST00000586548	CHD1	O14646	1710 aa		33.56	■■■□□ 2.96
CIRBP-208	ENST00000586548	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	33.54	■■■□□ 2.96
CIRBP-208	ENST00000586548	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		33.53	■■■□□ 2.96
CIRBP-208	ENST00000586548	JPH4	Q96JJ6	628 aa		33.51	■■■□□ 2.96
CIRBP-208	ENST00000586548	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CIRBP-208	ENST00000586548	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.49	■■■□□ 2.95
CIRBP-208	ENST00000586548	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CIRBP-208	ENST00000586548	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.43	■■■□□ 2.94
CIRBP-208	ENST00000586548	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	33.42	■■■□□ 2.94
CIRBP-208	ENST00000586548	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94	5e-6	■■■□□ 18.7
CIRBP-208	ENST00000586548	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
CIRBP-208	ENST00000586548	ARHGEF11	O15085	1522 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CIRBP-208	ENST00000586548	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CIRBP-208	ENST00000586548	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CIRBP-208	ENST00000586548	SHROOM2	Q13796	1616 aa		33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-208	ENST00000586548	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.31	■■■□□ 2.92
CIRBP-208	ENST00000586548	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		33.29	■■■□□ 2.92
CIRBP-208	ENST00000586548	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	33.28	■■■□□ 2.92
CIRBP-208	ENST00000586548	ITGAE	P38570	1179 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CIRBP-208	ENST00000586548	ABCA8	O94911	1581 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CIRBP-208	ENST00000586548	ARID3C	A6NKF2	412 aa		33.19	■■■□□ 2.9
CIRBP-208	ENST00000586548	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
CIRBP-208	ENST00000586548	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		33.18	■■■□□ 2.9
CIRBP-208	ENST00000586548	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CIRBP-208	ENST00000586548	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CIRBP-208	ENST00000586548	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CIRBP-208	ENST00000586548	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	PTPRG	P23470	1445 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		33.1	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CIRBP-208	ENST00000586548	ATP10B	O94823	1461 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CIRBP-208	ENST00000586548	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CIRBP-208	ENST00000586548	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CIRBP-208	ENST00000586548	UACA	Q9BZF9	1416 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIRBP-208	ENST00000586548	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CIRBP-208	ENST00000586548	KIF14	Q15058	1648 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CIRBP-208	ENST00000586548	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CIRBP-208	ENST00000586548	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CIRBP-208	ENST00000586548	ABCC2	Q92887	1545 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CIRBP-208	ENST00000586548	AKNA	Q7Z591	1439 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CIRBP-208	ENST00000586548	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
CIRBP-208	ENST00000586548	NAIP	Q13075	1403 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	MAPKBP1	O60336	1514 aa		32.8	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	DAPK1	P53355	1430 aa		32.76	■■■□□ 2.84
CIRBP-208	ENST00000586548	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CIRBP-208	ENST00000586548	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CIRBP-208	ENST00000586548	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CIRBP-208	ENST00000586548	ABCC5	O15440	1437 aa		32.71	■■■□□ 2.83

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