RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TMOD3-204ENST00000558666 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
TMOD3-204ENST00000558666 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-204ENST00000558666 SPOCK2Q92563 424 aa8.88□□□□□ -0.99
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-204ENST00000558666 PHF12Q96QT6 1004 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-204ENST00000558666 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.82□□□□□ -1
TMOD3-204ENST00000558666 GABBR2O75899 941 aa8.82□□□□□ -1
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TMOD3-204ENST00000558666 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.78□□□□□ -1
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TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K13O43283 966 aa8.74□□□□□ -1.01
TMOD3-204ENST00000558666 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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TMOD3-204ENST00000558666 PYGBP11216 843 aa8.73□□□□□ -1.01
TMOD3-204ENST00000558666 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
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TMOD3-204ENST00000558666 TRIM41Q8WV44 630 aa8.69□□□□□ -1.02
TMOD3-204ENST00000558666 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-204ENST00000558666 IFNL1Q8IU54 200 aa8.67□□□□□ -1.02
TMOD3-204ENST00000558666 TRPC6Q9Y210 931 aa8.66□□□□□ -1.02
TMOD3-204ENST00000558666 POTEIP0CG38 1075 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-204ENST00000558666 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-204ENST00000558666 TIE1P35590 1138 aa8.62□□□□□ -1.03
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TMOD3-204ENST00000558666 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-204ENST00000558666 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
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TMOD3-204ENST00000558666 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
TMOD3-204ENST00000558666 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-204ENST00000558666 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-204ENST00000558666 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
TMOD3-204ENST00000558666 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.56□□□□□ -1.04
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TMOD3-204ENST00000558666 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TMOD3-204ENST00000558666 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.54□□□□□ -1.04
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TMOD3-204ENST00000558666 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.52□□□□□ -1.05
TMOD3-204ENST00000558666 RGL2O15211 777 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD3-204ENST00000558666 VGFO15240 615 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-204ENST00000558666 SLC39A7Q92504 469 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-204ENST00000558666 METRNQ9UJH8 293 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD3-204ENST00000558666 C7P10643 843 aa8.47□□□□□ -1.05
TMOD3-204ENST00000558666 IER5LQ5T953 404 aa8.47□□□□□ -1.05
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TMOD3-204ENST00000558666 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.45□□□□□ -1.06
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TMOD3-204ENST00000558666 GOLGA2Q08379 1002 aa8.42□□□□□ -1.06
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TMOD3-204ENST00000558666 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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TMOD3-204ENST00000558666 PLCG2P16885 1265 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-204ENST00000558666 LHX8Q68G74 356 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD3-204ENST00000558666 POTEB2H3BUK9 544 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-204ENST00000558666 STK24Q9Y6E0 443 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD3-204ENST00000558666 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-204ENST00000558666 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.36□□□□□ -1.07
TMOD3-204ENST00000558666 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.36□□□□□ -1.07
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TMOD3-204ENST00000558666 SOX12O15370 315 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD3-204ENST00000558666 PHF8Q9UPP1 1060 aa8.29□□□□□ -1.08
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TMOD3-204ENST00000558666 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.27□□□□□ -1.09
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TMOD3-204ENST00000558666 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-204ENST00000558666 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD3-204ENST00000558666 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TMOD3-204ENST00000558666 SMARCA4P51532 1647 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-204ENST00000558666 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-204ENST00000558666 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TMOD3-204ENST00000558666 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.21□□□□□ -1.1
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