RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 METRNQ9UJH8 293 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 SLC39A7Q92504 469 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 C7P10643 843 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 MAMSTRQ6ZN01 415 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRB-207ENST00000549400 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 CSRNP3Q8WYN3 585 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 POTEJP0CG39 1038 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRB-207ENST00000549400 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-207ENST00000549400 EHMT2Q96KQ7 1210 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-207ENST00000549400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-207ENST00000549400 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-207ENST00000549400 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-207ENST00000549400 SEC24BO95487 1268 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 KIF12Q96FN5 646 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 POTEFA5A3E0 1075 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 TRPC6Q9Y210 931 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRB-207ENST00000549400 MAP3K13O43283 966 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 TIE1P35590 1138 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 PLEKHG5O94827 1062 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 MYO15BQ96JP2 1530 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 MIER1Q8N108 512 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRB-207ENST00000549400 ST18O60284 1047 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 RASEFQ8IZ41 740 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 IER5LQ5T953 404 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 ARXQ96QS3 562 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 PLCG2P16885 1265 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRB-207ENST00000549400 MMRN1Q13201 1228 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 PROM2Q8N271 834 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 SNPHO15079 494 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 IFNL1Q8IU54 200 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-207ENST00000549400 MARVELD3Q96A59 401 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 NACADO15069 1562 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 OCEL1Q9H607 264 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 NUBP1P53384 320 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 FAM212AQ96EL1 285 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 ABCC9O60706 1549 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRB-207ENST00000549400 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 EMP3P54852 163 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 PYGBP11216 843 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-207ENST00000549400 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 GOLGA2Q08379 1002 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRB-207ENST00000549400 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-207ENST00000549400 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-207ENST00000549400 SCRIBQ14160 1630 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-207ENST00000549400 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-207ENST00000549400 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-207ENST00000549400 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 G3V3G9 751 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 HOMEZQ8IX15 550 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 KLHL34Q8N239 644 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 FBXO3Q9UK99 471 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 ERBB3P21860 1342 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 FKBP8Q14318 412 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-207ENST00000549400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-207ENST00000549400 GSE1Q14687 1217 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRB-207ENST00000549400 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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