RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 STAG3Q9UJ98 1225 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 POTEFA5A3E0 1075 aa15.55■□□□□ 0.08
PTPRQ-204ENST00000549355 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRQ-204ENST00000549355 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRQ-204ENST00000549355 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP15.46■□□□□ 0.07
PTPRQ-204ENST00000549355 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRQ-204ENST00000549355 TRPC6Q9Y210 931 aa15.3■□□□□ 0.04
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF12Q96FN5 646 aa15.27■□□□□ 0.04
PTPRQ-204ENST00000549355 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
PTPRQ-204ENST00000549355 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRQ-204ENST00000549355 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
PTPRQ-204ENST00000549355 ST18O60284 1047 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRQ-204ENST00000549355 MMRN1Q13201 1228 aa15.18■□□□□ 0.02
PTPRQ-204ENST00000549355 TIE1P35590 1138 aa15.16■□□□□ 0.02
PTPRQ-204ENST00000549355 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.13■□□□□ 0.01
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP3K13O43283 966 aa15.09■□□□□ 0.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.08■□□□□ 0
PTPRQ-204ENST00000549355 SEC24BO95487 1268 aa15.02■□□□□ -0
PTPRQ-204ENST00000549355 IER5LQ5T953 404 aa15□□□□□ -0.01
PTPRQ-204ENST00000549355 SLAIN1Q8ND83 568 aa15□□□□□ -0.01
PTPRQ-204ENST00000549355 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRQ-204ENST00000549355 RASEFQ8IZ41 740 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRQ-204ENST00000549355 PROM2Q8N271 834 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRQ-204ENST00000549355 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRQ-204ENST00000549355 SGIP1Q9BQI5 828 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRQ-204ENST00000549355 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRQ-204ENST00000549355 MARVELD3Q96A59 401 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRQ-204ENST00000549355 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRQ-204ENST00000549355 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRQ-204ENST00000549355 IFNL1Q8IU54 200 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 PLCG2P16885 1265 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 POTEB3A0JP26 581 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 POTEBQ6S5H4 581 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 SNPHO15079 494 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRQ-204ENST00000549355 OCEL1Q9H607 264 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRQ-204ENST00000549355 NUBP1P53384 320 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRQ-204ENST00000549355 MIER1Q8N108 512 aa14.56□□□□□ -0.08
PTPRQ-204ENST00000549355 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PTPRQ-204ENST00000549355 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.52□□□□□ -0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 EMP3P54852 163 aa14.51□□□□□ -0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 PLEKHG5O94827 1062 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM205CA6NFA0 338 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRQ-204ENST00000549355 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM212AQ96EL1 285 aa14.3□□□□□ -0.12
PTPRQ-204ENST00000549355 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.28□□□□□ -0.12
PTPRQ-204ENST00000549355 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.26□□□□□ -0.13
PTPRQ-204ENST00000549355 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.25□□□□□ -0.13
PTPRQ-204ENST00000549355 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PTPRQ-204ENST00000549355 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.23□□□□□ -0.13
PTPRQ-204ENST00000549355 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PTPRQ-204ENST00000549355 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PTPRQ-204ENST00000549355 PYGBP11216 843 aa14.2□□□□□ -0.14
PTPRQ-204ENST00000549355 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PTPRQ-204ENST00000549355 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
PTPRQ-204ENST00000549355 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.08□□□□□ -0.16
PTPRQ-204ENST00000549355 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.06□□□□□ -0.16
PTPRQ-204ENST00000549355 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
PTPRQ-204ENST00000549355 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRQ-204ENST00000549355 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.05□□□□□ -0.16
PTPRQ-204ENST00000549355 ERBB3P21860 1342 aa14.02□□□□□ -0.17
PTPRQ-204ENST00000549355 EHMT2Q96KQ7 1210 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRQ-204ENST00000549355 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 GOLGA2Q08379 1002 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 BOLA1Q9Y3E2 137 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 DOK7Q18PE1 504 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRQ-204ENST00000549355 PSEN1P49768 467 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRQ-204ENST00000549355 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
PTPRQ-204ENST00000549355 PTGER2P43116 358 aa13.86□□□□□ -0.19
PTPRQ-204ENST00000549355 GPR153Q6NV75 609 aa13.79□□□□□ -0.2
PTPRQ-204ENST00000549355 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa13.76□□□□□ -0.21
PTPRQ-204ENST00000549355 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.74□□□□□ -0.21
PTPRQ-204ENST00000549355 RIMBP2O15034 1052 aa13.73□□□□□ -0.21
PTPRQ-204ENST00000549355 GSE1Q14687 1217 aa13.72□□□□□ -0.21
PTPRQ-204ENST00000549355 G3V3G9 751 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRQ-204ENST00000549355 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PTPRQ-204ENST00000549355 CABP2Q9NPB3 220 aa13.7□□□□□ -0.22
PTPRQ-204ENST00000549355 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa13.67□□□□□ -0.22
PTPRQ-204ENST00000549355 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.66□□□□□ -0.22
PTPRQ-204ENST00000549355 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP13.63□□□□□ -0.23
PTPRQ-204ENST00000549355 ARSIQ5FYB1 569 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRQ-204ENST00000549355 MICALL2Q8IY33 904 aa13.56□□□□□ -0.24
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PTPRQ-204ENST00000549355 POTEEQ6S8J3 1075 aa13.53□□□□□ -0.24
PTPRQ-204ENST00000549355 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP13.52□□□□□ -0.25
PTPRQ-204ENST00000549355 HCSTQ9UBK5 93 aa13.5□□□□□ -0.25
PTPRQ-204ENST00000549355 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.48□□□□□ -0.25
PTPRQ-204ENST00000549355 FKBP8Q14318 412 aa13.43□□□□□ -0.26
PTPRQ-204ENST00000549355 KLHL34Q8N239 644 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms