RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536244.5

KCTD20-210, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene KCTD20, Length 5,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD20-210ENST00000536244 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.91■■□□□ 1.42
KCTD20-210ENST00000536244 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.91■■□□□ 1.42
KCTD20-210ENST00000536244 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 20.8
KCTD20-210ENST00000536244 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
KCTD20-210ENST00000536244 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.84■■□□□ 1.41
KCTD20-210ENST00000536244 CDCA8Q53HL2 280 aa23.81■■□□□ 1.4
KCTD20-210ENST00000536244 CASC1Q6TDU7 716 aa23.8■■□□□ 1.4
KCTD20-210ENST00000536244 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
KCTD20-210ENST00000536244 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.8■■□□□ 1.4
KCTD20-210ENST00000536244 CFAP53Q96M91 514 aa23.79■■□□□ 1.4
KCTD20-210ENST00000536244 CLIP1P30622 1438 aa23.78■■□□□ 1.4
KCTD20-210ENST00000536244 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
KCTD20-210ENST00000536244 EEA1Q15075 1411 aa23.74■■□□□ 1.39
KCTD20-210ENST00000536244 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.72■■□□□ 1.39
KCTD20-210ENST00000536244 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
KCTD20-210ENST00000536244 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
KCTD20-210ENST00000536244 SCRIBQ14160 1630 aa23.67■■□□□ 1.38
KCTD20-210ENST00000536244 KNSTRNQ9Y448 316 aa23.64■■□□□ 1.38
KCTD20-210ENST00000536244 MS4A1P11836 297 aa23.64■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa23.6■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA3Q08378 1498 aa23.58■■□□□ 1.37
KCTD20-210ENST00000536244 NRDCO43847 1150 aa23.58■■□□□ 1.36
KCTD20-210ENST00000536244 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.57■■□□□ 1.36
KCTD20-210ENST00000536244 NUDCQ9Y266 331 aa23.54■■□□□ 1.36
KCTD20-210ENST00000536244 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
KCTD20-210ENST00000536244 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa23.51■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 CEP162Q5TB80 1403 aa23.49■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.49■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.48■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 CFAP44Q96MT7 982 aa23.48■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.46■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.46■■□□□ 1.35
KCTD20-210ENST00000536244 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.43■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 RGS3P49796 1198 aa23.41■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 C14orf37Q86TY3 774 aa23.4■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 RGL3Q3MIN7 710 aa23.39■■□□□ 1.34
KCTD20-210ENST00000536244 HSCBQ8IWL3 235 aa23.39■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.38■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 CCER2I3L3R5 266 aa23.36■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 PLCB2Q00722 1185 aa23.36■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 PTMSP20962 102 aa23.35■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 ZBTB7CA1YPR0 619 aa23.34■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 MSNP26038 577 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 A0A0G2JS52 829 aa23.34■■□□□ 1.33
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.32■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 FGD1P98174 961 aa23.31■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.3■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 MCCP23508 829 aa23.3■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 NEUROD2Q15784 382 aa23.29■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 KCNJ4P48050 445 aa23.27■■□□□ 1.32
KCTD20-210ENST00000536244 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.24■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 KIF27Q86VH2 1401 aa23.24■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 TMF1P82094 1093 aa23.24■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 DEKP35659 375 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.23■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.21■■□□□ 1.312e-8■■■■□ 23
KCTD20-210ENST00000536244 KCNH8Q96L42 1107 aa23.21■■□□□ 1.31
KCTD20-210ENST00000536244 POGKQ9P215 609 aa23.2■■□□□ 1.3
KCTD20-210ENST00000536244 GBP4Q96PP9 640 aa23.18■■□□□ 1.3
KCTD20-210ENST00000536244 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
KCTD20-210ENST00000536244 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.14■■□□□ 1.3
KCTD20-210ENST00000536244 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.13■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23.12■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.12■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.11■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 DRC7Q8IY82 874 aa23.11■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.09■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
KCTD20-210ENST00000536244 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 PLEKHG5O94827 1062 aa23.05■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 GOLGA2Q08379 1002 aa23.05■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 KANK1Q14678 1352 aa23.03■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 MORC1Q86VD1 984 aa23.02■■□□□ 1.28
KCTD20-210ENST00000536244 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms