RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516663.1

RNU6-521P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 521, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-521P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEFA5A3E0 1075 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-521P-201ENST00000516663 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-521P-201ENST00000516663 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RNU6-521P-201ENST00000516663 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-521P-201ENST00000516663 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RNU6-521P-201ENST00000516663 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-521P-201ENST00000516663 EMP3P54852 163 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 SEC24BO95487 1268 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEB3A0JP26 581 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 SNPHO15079 494 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEBQ6S5H4 581 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 FBLN2P98095 1184 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-521P-201ENST00000516663 FAM205CA6NFA0 338 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-521P-201ENST00000516663 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-521P-201ENST00000516663 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RNU6-521P-201ENST00000516663 CREBZFQ9NS37 354 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-521P-201ENST00000516663 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-521P-201ENST00000516663 TIE1P35590 1138 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-521P-201ENST00000516663 IER5LQ5T953 404 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-521P-201ENST00000516663 TRPC6Q9Y210 931 aa6.41□□□□□ -1.38
RNU6-521P-201ENST00000516663 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-521P-201ENST00000516663 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
RNU6-521P-201ENST00000516663 PTGER2P43116 358 aa6.38□□□□□ -1.39
RNU6-521P-201ENST00000516663 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-521P-201ENST00000516663 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-521P-201ENST00000516663 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.34□□□□□ -1.39
RNU6-521P-201ENST00000516663 PLCG2P16885 1265 aa6.33□□□□□ -1.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 Q6ZNB5 142 aa6.31□□□□□ -1.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 KIF12Q96FN5 646 aa6.29□□□□□ -1.4
RNU6-521P-201ENST00000516663 ERBB3P21860 1342 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-521P-201ENST00000516663 RGS20O76081 388 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-521P-201ENST00000516663 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-521P-201ENST00000516663 HCSTQ9UBK5 93 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-521P-201ENST00000516663 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.22□□□□□ -1.41
RNU6-521P-201ENST00000516663 MAP3K13O43283 966 aa6.2□□□□□ -1.42
RNU6-521P-201ENST00000516663 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
RNU6-521P-201ENST00000516663 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-521P-201ENST00000516663 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-521P-201ENST00000516663 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RNU6-521P-201ENST00000516663 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.15□□□□□ -1.42
RNU6-521P-201ENST00000516663 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RNU6-521P-201ENST00000516663 C3orf67Q6ZVT6 689 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-521P-201ENST00000516663 OCEL1Q9H607 264 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF710Q8N1W2 664 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RNU6-521P-201ENST00000516663 TRAF7Q6Q0C0 670 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-521P-201ENST00000516663 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
RNU6-521P-201ENST00000516663 FOXD4L1Q9NU39 408 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-521P-201ENST00000516663 LCE2BO14633 110 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-521P-201ENST00000516663 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-521P-201ENST00000516663 KCNA4P22459 653 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF787Q6DD87 383 aa6□□□□□ -1.45
RNU6-521P-201ENST00000516663 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.45
RNU6-521P-201ENST00000516663 A0A0G2JS52 829 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.96□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 ATXN8OSP0DMR3 200 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 DOK7Q18PE1 504 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.94□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 LAPTM4AQ15012 233 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 IFFO2Q5TF58 517 aa5.92□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 RIMBP2O15034 1052 aa5.9□□□□□ -1.46
RNU6-521P-201ENST00000516663 IFNL1Q8IU54 200 aa5.86□□□□□ -1.47
RNU6-521P-201ENST00000516663 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
RNU6-521P-201ENST00000516663 STK17AQ9UEE5 414 aa5.83□□□□□ -1.48
RNU6-521P-201ENST00000516663 GFRA3O60609 400 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-521P-201ENST00000516663 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-521P-201ENST00000516663 RASEFQ8IZ41 740 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.77□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PBX2P40425 430 aa5.74□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 PTPN5P54829 565 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 GPR153Q6NV75 609 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 TREML4Q6UXN2 200 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 ADGRD1Q6QNK2 874 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 AXIN2Q9Y2T1 843 aa5.72□□□□□ -1.49
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.71□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 POTEEQ6S8J3 1075 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 G3V3G9 751 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
RNU6-521P-201ENST00000516663 ARSIQ5FYB1 569 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU6-521P-201ENST00000516663 GOLGA2Q08379 1002 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU6-521P-201ENST00000516663 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RNU6-521P-201ENST00000516663 STAC3Q96MF2 364 aa5.62□□□□□ -1.51
RNU6-521P-201ENST00000516663 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms