RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505306.5

ITGA3-204, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 5,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-204ENST00000505306 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-204ENST00000505306 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.48■■□□□ 1.19
ITGA3-204ENST00000505306 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
ITGA3-204ENST00000505306 RGL3Q3MIN7 710 aa22.45■■□□□ 1.18
ITGA3-204ENST00000505306 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.42■■□□□ 1.18
ITGA3-204ENST00000505306 FKBP8Q14318 412 aa22.42■■□□□ 1.18
ITGA3-204ENST00000505306 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
ITGA3-204ENST00000505306 MLECQ14165 292 aa22.39■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 TMC1Q8TDI8 760 aa22.36■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 CUX2O14529 1486 aa22.36■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
ITGA3-204ENST00000505306 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.32■■□□□ 1.16
ITGA3-204ENST00000505306 CEP162Q5TB80 1403 aa22.32■■□□□ 1.16
ITGA3-204ENST00000505306 MIER1Q8N108 512 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA3-204ENST00000505306 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.3■■□□□ 1.16
ITGA3-204ENST00000505306 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.27■■□□□ 1.16
ITGA3-204ENST00000505306 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.26■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 SMARCA2P51531 1590 aa22.24■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 POGKQ9P215 609 aa22.21■■□□□ 1.15
ITGA3-204ENST00000505306 SOGA1O94964 1423 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-204ENST00000505306 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.19■■□□□ 1.14
ITGA3-204ENST00000505306 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ITGA3-204ENST00000505306 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.17■■□□□ 1.14
ITGA3-204ENST00000505306 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 MRS2Q9HD23 443 aa22.14■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 GGT6Q6P531 493 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 KANK1Q14678 1352 aa22.13■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 CDCA8Q53HL2 280 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 ARXQ96QS3 562 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-204ENST00000505306 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-204ENST00000505306 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-204ENST00000505306 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-204ENST00000505306 CFAP53Q96M91 514 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-204ENST00000505306 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-204ENST00000505306 NBR1Q14596 966 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-204ENST00000505306 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-204ENST00000505306 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
ITGA3-204ENST00000505306 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGA3-204ENST00000505306 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ITGA3-204ENST00000505306 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGA3-204ENST00000505306 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-204ENST00000505306 OSCARQ8IYS5 282 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-204ENST00000505306 JPH4Q96JJ6 628 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGA3-204ENST00000505306 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 NPHP1O15259 732 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 SOX12O15370 315 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 NUDCQ9Y266 331 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 ABCC8Q09428 1581 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 STK26Q9P289 416 aa21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.84■■□□□ 1.09
ITGA3-204ENST00000505306 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.82■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 NEUROD2Q15784 382 aa21.82■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 KIF3BO15066 747 aa21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 FMN1Q68DA7 1419 aa21.79■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 PKD2Q13563 968 aa21.77■■□□□ 1.08
ITGA3-204ENST00000505306 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 TMF1P82094 1093 aa21.76■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.75■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 EID1Q9Y6B2 187 aa21.73■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 WIZO95785 1651 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.71■■□□□ 1.07
ITGA3-204ENST00000505306 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.69■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 NUP155O75694 1391 aa21.68■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.68■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.68■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 PTPRGP23470 1445 aa21.66■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.64■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.64■■□□□ 1.06
ITGA3-204ENST00000505306 FOXD1Q16676 465 aa21.64■■□□□ 1.06
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