RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 CHADLQ6NUI6 762 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 RASEFQ8IZ41 740 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 NACADO15069 1562 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM212AQ96EL1 285 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-212ENST00000491266 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.7□□□□□ -0.54
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RABGGTB-212ENST00000491266 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-212ENST00000491266 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa11.64□□□□□ -0.55
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RABGGTB-212ENST00000491266 PLCB2Q00722 1185 aa11.61□□□□□ -0.55
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RABGGTB-212ENST00000491266 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-212ENST00000491266 HS6ST3Q8IZP7 471 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-212ENST00000491266 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-212ENST00000491266 SCRIBQ14160 1630 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-212ENST00000491266 PYGBP11216 843 aa11.53□□□□□ -0.56
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RABGGTB-212ENST00000491266 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.53□□□□□ -0.56
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RABGGTB-212ENST00000491266 VGFO15240 615 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-212ENST00000491266 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-212ENST00000491266 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-212ENST00000491266 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
RABGGTB-212ENST00000491266 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
RABGGTB-212ENST00000491266 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
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RABGGTB-212ENST00000491266 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.39□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 STK25O00506 426 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 CD44P16070 742 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 KIF12Q96FN5 646 aa11.38□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 C19orf67A6NJJ6 358 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.37□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
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RABGGTB-212ENST00000491266 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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RABGGTB-212ENST00000491266 HAX1O00165 279 aa11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
RABGGTB-212ENST00000491266 MAP3K13O43283 966 aa11.33□□□□□ -0.6
RABGGTB-212ENST00000491266 IFNL1Q8IU54 200 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-212ENST00000491266 STK24Q9Y6E0 443 aa11.32□□□□□ -0.6
RABGGTB-212ENST00000491266 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-212ENST00000491266 PHF12Q96QT6 1004 aa11.29□□□□□ -0.6
RABGGTB-212ENST00000491266 PSEN1P49768 467 aa11.28□□□□□ -0.6
RABGGTB-212ENST00000491266 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.28□□□□□ -0.6
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RABGGTB-212ENST00000491266 MS4A3Q96HJ5 214 aa11.19□□□□□ -0.62
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPC6Q9Y210 931 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-212ENST00000491266 EVX2Q03828 476 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-212ENST00000491266 MFRPQ9BY79 579 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-212ENST00000491266 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.14□□□□□ -0.63
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RABGGTB-212ENST00000491266 CLCN6P51797 869 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-212ENST00000491266 CABP2Q9NPB3 220 aa11.12□□□□□ -0.63
RABGGTB-212ENST00000491266 TIE1P35590 1138 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-212ENST00000491266 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.11□□□□□ -0.63
RABGGTB-212ENST00000491266 SOX12O15370 315 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTB-212ENST00000491266 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.1□□□□□ -0.63
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.09□□□□□ -0.63
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RABGGTB-212ENST00000491266 NLRP6P59044 892 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-212ENST00000491266 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-212ENST00000491266 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.05□□□□□ -0.64
RABGGTB-212ENST00000491266 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-212ENST00000491266 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-212ENST00000491266 SMARCA4P51532 1647 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-212ENST00000491266 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
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RABGGTB-212ENST00000491266 PPP1R37O75864 691 aa11□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 WIZO95785 1651 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 GOLGA2Q08379 1002 aa10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-212ENST00000491266 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.95□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 GABBR2O75899 941 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 BCANQ96GW7 911 aa10.94□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.93□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10.91□□□□□ -0.66
RABGGTB-212ENST00000491266 NCAPD3P42695 1498 aa10.9□□□□□ -0.66
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