RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHADL	Q6NUI6	762 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
RABGGTB-212	ENST00000491266	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.74	□□□□□ -0.53
RABGGTB-212	ENST00000491266	NACAD	O15069	1562 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM212A	Q96EL1	285 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RABGGTB-212	ENST00000491266	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
RABGGTB-212	ENST00000491266	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.7	□□□□□ -0.54
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RABGGTB-212	ENST00000491266	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RABGGTB-212	ENST00000491266	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RABGGTB-212	ENST00000491266	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLCB2	Q00722	1185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RABGGTB-212	ENST00000491266	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	11.58	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.54	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCRIB	Q14160	1630 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	PYGB	P11216	843 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.53	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		11.53	□□□□□ -0.56
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		11.5	□□□□□ -0.57
RABGGTB-212	ENST00000491266	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
RABGGTB-212	ENST00000491266	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		11.43	□□□□□ -0.58
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
RABGGTB-212	ENST00000491266	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		11.39	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK25	O00506	426 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF12	Q96FN5	646 aa		11.38	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.37	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		11.35	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	HAX1	O00165	279 aa		11.34	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K13	O43283	966 aa		11.33	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.32	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF12	Q96QT6	1004 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSEN1	P49768	467 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RABGGTB-212	ENST00000491266	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		11.26	□□□□□ -0.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RABGGTB-212	ENST00000491266	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRPC6	Q9Y210	931 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVX2	Q03828	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MFRP	Q9BY79	579 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLCN6	P51797	869 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	CABP2	Q9NPB3	220 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIE1	P35590	1138 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOX12	O15370	315 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RABGGTB-212	ENST00000491266	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	NLRP6	P59044	892 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		11.05	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	11.04	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMARCA4	P51532	1647 aa		11.04	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	11.03	□□□□□ -0.64
RABGGTB-212	ENST00000491266	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP1R37	O75864	691 aa		11	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		11	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		10.98	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	WIZ	O95785	1651 aa		10.97	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA2	Q08379	1002 aa		10.96	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
RABGGTB-212	ENST00000491266	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		10.95	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GABBR2	O75899	941 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.94	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	10.93	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		10.93	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	10.92	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		10.91	□□□□□ -0.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NCAPD3	P42695	1498 aa		10.9	□□□□□ -0.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms