RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490322.1

SMYD3-215, Transcript of SET and MYND domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMYD3, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3-215ENST00000490322 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 C7P10643 843 aa6.25□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 SLC39A7Q92504 469 aa6.25□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 SLC24A1O60721 1099 aa6.23□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.23□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.22□□□□□ -1.41
SMYD3-215ENST00000490322 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.21□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.2□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.17□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.17□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SMYD3-215ENST00000490322 POTEFA5A3E0 1075 aa6.14□□□□□ -1.43
SMYD3-215ENST00000490322 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
SMYD3-215ENST00000490322 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
SMYD3-215ENST00000490322 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 MMRN1Q13201 1228 aa6.07□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 TRPC6Q9Y210 931 aa6.07□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 KIF12Q96FN5 646 aa6.06□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.06□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.05□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 ST18O60284 1047 aa6.05□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 SEC24BO95487 1268 aa6.04□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.04□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 TIE1P35590 1138 aa6.03□□□□□ -1.44
SMYD3-215ENST00000490322 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.02□□□□□ -1.45
SMYD3-215ENST00000490322 TTLL13PA6NNM8 815 aa6□□□□□ -1.45
SMYD3-215ENST00000490322 MAP3K13O43283 966 aa6□□□□□ -1.45
SMYD3-215ENST00000490322 IER5LQ5T953 404 aa5.97□□□□□ -1.45
SMYD3-215ENST00000490322 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.97□□□□□ -1.45
SMYD3-215ENST00000490322 FKBP8Q14318 412 aa5.96□□□□□ -1.46
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMYD3-215ENST00000490322 RASEFQ8IZ41 740 aa5.93□□□□□ -1.46
SMYD3-215ENST00000490322 MARVELD3Q96A59 401 aa5.93□□□□□ -1.46
SMYD3-215ENST00000490322 PLCG2P16885 1265 aa5.9□□□□□ -1.46
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.88□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 SNPHO15079 494 aa5.87□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.86□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.86□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 EMP3P54852 163 aa5.85□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 IFNL1Q8IU54 200 aa5.85□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.85□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.85□□□□□ -1.47
SMYD3-215ENST00000490322 PROM2Q8N271 834 aa5.83□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 PLEKHG5O94827 1062 aa5.82□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 POTEB3A0JP26 581 aa5.81□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 POTEBQ6S5H4 581 aa5.81□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 HS3ST6Q96QI5 342 aa5.81□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 MIER1Q8N108 512 aa5.8□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 OCEL1Q9H607 264 aa5.8□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 FAM205CA6NFA0 338 aa5.79□□□□□ -1.48
SMYD3-215ENST00000490322 NUBP1P53384 320 aa5.75□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 C3orf67Q6ZVT6 689 aa5.75□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 FBXO3Q9UK99 471 aa5.73□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.72□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 FAM212AQ96EL1 285 aa5.72□□□□□ -1.49
SMYD3-215ENST00000490322 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SMYD3-215ENST00000490322 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.68□□□□□ -1.5
SMYD3-215ENST00000490322 PYGBP11216 843 aa5.66□□□□□ -1.5
SMYD3-215ENST00000490322 PLCB2Q00722 1185 aa5.66□□□□□ -1.5
SMYD3-215ENST00000490322 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMYD3-215ENST00000490322 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.66□□□□□ -1.5
SMYD3-215ENST00000490322 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 GOLGA2Q08379 1002 aa5.62□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.62□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 ERBB3P21860 1342 aa5.62□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF710Q8N1W2 664 aa5.61□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.6□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 BCANQ96GW7 911 aa5.59□□□□□ -1.51
SMYD3-215ENST00000490322 VASPP50552 380 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 DCAF8L2P0C7V8 631 aa5.57□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 DOK7Q18PE1 504 aa5.57□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 DPY19L2Q6NUT2 758 aa5.57□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.56□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 PTGER2P43116 358 aa5.55□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 G3V3G9 751 aa5.54□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 PSEN1P49768 467 aa5.53□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.53□□□□□ -1.52
SMYD3-215ENST00000490322 RIMBP2O15034 1052 aa5.52□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.52□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.51□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.51□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.5□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.48□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 CABP2Q9NPB3 220 aa5.48□□□□□ -1.53
SMYD3-215ENST00000490322 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 9.6
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