RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 PLCD3Q8N3E9 789 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 SLC39A7Q92504 469 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 METRNQ9UJH8 293 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 POTEMA6NI47 508 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 C7P10643 843 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
PTPRC-211ENST00000484135 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRC-211ENST00000484135 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRC-211ENST00000484135 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRC-211ENST00000484135 POTEGQ6S5H5 508 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRC-211ENST00000484135 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRC-211ENST00000484135 VASPP50552 380 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH10Q9P2E7 1040 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRC-211ENST00000484135 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
PTPRC-211ENST00000484135 KIF12Q96FN5 646 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRC-211ENST00000484135 POTEJP0CG39 1038 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRC-211ENST00000484135 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRC-211ENST00000484135 KLHL34Q8N239 644 aa12.87□□□□□ -0.35
PTPRC-211ENST00000484135 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
PTPRC-211ENST00000484135 MAP3K13O43283 966 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-211ENST00000484135 TIE1P35590 1138 aa12.84□□□□□ -0.35
PTPRC-211ENST00000484135 SEC24BO95487 1268 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRC-211ENST00000484135 RASEFQ8IZ41 740 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRC-211ENST00000484135 NUBP1P53384 320 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-211ENST00000484135 TRPC6Q9Y210 931 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRC-211ENST00000484135 FAM212AQ96EL1 285 aa12.76□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 POTEFA5A3E0 1075 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.71□□□□□ -0.37
PTPRC-211ENST00000484135 IER5LQ5T953 404 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-211ENST00000484135 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.69□□□□□ -0.38
PTPRC-211ENST00000484135 SPOCK2Q92563 424 aa12.68□□□□□ -0.38
PTPRC-211ENST00000484135 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PTPRC-211ENST00000484135 GSE1Q14687 1217 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRC-211ENST00000484135 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRC-211ENST00000484135 PLCG2P16885 1265 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.58□□□□□ -0.4
PTPRC-211ENST00000484135 PYGBP11216 843 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRC-211ENST00000484135 CDAN1Q8IWY9 1227 aa12.57□□□□□ -0.4
PTPRC-211ENST00000484135 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
PTPRC-211ENST00000484135 IFNL1Q8IU54 200 aa12.56□□□□□ -0.4
PTPRC-211ENST00000484135 ST18O60284 1047 aa12.48□□□□□ -0.41
PTPRC-211ENST00000484135 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-211ENST00000484135 OCEL1Q9H607 264 aa12.43□□□□□ -0.42
PTPRC-211ENST00000484135 SNPHO15079 494 aa12.42□□□□□ -0.42
PTPRC-211ENST00000484135 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.41□□□□□ -0.42
PTPRC-211ENST00000484135 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRC-211ENST00000484135 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM41Q8WV44 630 aa12.38□□□□□ -0.43
PTPRC-211ENST00000484135 GOLGA2Q08379 1002 aa12.33□□□□□ -0.44
PTPRC-211ENST00000484135 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.29□□□□□ -0.44
PTPRC-211ENST00000484135 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 PSEN1P49768 467 aa12.26□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 MMRN1Q13201 1228 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 MARVELD3Q96A59 401 aa12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.24□□□□□ -0.45
PTPRC-211ENST00000484135 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
PTPRC-211ENST00000484135 EMP3P54852 163 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-211ENST00000484135 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.19□□□□□ -0.46
PTPRC-211ENST00000484135 PKD2Q13563 968 aa12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-211ENST00000484135 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.18□□□□□ -0.46
PTPRC-211ENST00000484135 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.17□□□□□ -0.46
PTPRC-211ENST00000484135 VGFO15240 615 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 CABP2Q9NPB3 220 aa12.13□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 G3V3G9 751 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.12□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 RGL2O15211 777 aa12.09□□□□□ -0.47
PTPRC-211ENST00000484135 FAM205CA6NFA0 338 aa12.08□□□□□ -0.48
PTPRC-211ENST00000484135 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.07□□□□□ -0.48
PTPRC-211ENST00000484135 STK25O00506 426 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 EFCAB3Q8N7B9 438 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 STK24Q9Y6E0 443 aa12.01□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.99□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRC-211ENST00000484135 POTEB3A0JP26 581 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRC-211ENST00000484135 POTEBQ6S5H4 581 aa11.95□□□□□ -0.5
PTPRC-211ENST00000484135 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
PTPRC-211ENST00000484135 DOK7Q18PE1 504 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRC-211ENST00000484135 SOX12O15370 315 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRC-211ENST00000484135 RIMBP2O15034 1052 aa11.9□□□□□ -0.5
PTPRC-211ENST00000484135 ERBB3P21860 1342 aa11.89□□□□□ -0.51
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