RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483088.1

N4BP2L2-208, Transcript of NEDD4 binding protein 2 like 2, human

TSL 2

Gene N4BP2L2, Length 716 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP2L2-208	ENST00000483088	LHX8	Q68G74	356 aa		9.56	□□□□□ -0.88
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FAM212A	Q96EL1	285 aa		9.56	□□□□□ -0.88
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		9.55	□□□□□ -0.88
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		9.54	□□□□□ -0.88
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CLCN6	P51797	869 aa		9.52	□□□□□ -0.89
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GSE1	Q14687	1217 aa		9.52	□□□□□ -0.89
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PHF12	Q96QT6	1004 aa		9.51	□□□□□ -0.89
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GABBR2	O75899	941 aa		9.5	□□□□□ -0.89
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		9.48	□□□□□ -0.89
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	9.47	□□□□□ -0.89
N4BP2L2-208	ENST00000483088	KIF12	Q96FN5	646 aa		9.46	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		9.43	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MAP3K13	O43283	966 aa		9.42	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PYGB	P11216	843 aa		9.42	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		9.41	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		9.4	□□□□□ -0.9
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TRIM41	Q8WV44	630 aa		9.39	□□□□□ -0.91
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		9.38	□□□□□ -0.91
N4BP2L2-208	ENST00000483088	IFNL1	Q8IU54	200 aa		9.34	□□□□□ -0.91
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PKD2	Q13563	968 aa		9.33	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		9.32	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		9.32	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		9.31	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POTEI	P0CG38	1075 aa		9.3	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	9.3	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TRPC6	Q9Y210	931 aa		9.3	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TIE1	P35590	1138 aa		9.28	□□□□□ -0.92
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		9.22	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	9.22	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	9.22	□□□□□ -0.93
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PSEN1	P49768	467 aa		9.21	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	9.21	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		9.21	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RGL2	O15211	777 aa		9.2	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	9.2	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	9.19	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	9.17	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		9.17	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		9.16	□□□□□ -0.94
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SLC39A7	Q92504	469 aa		9.14	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	9.14	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	C7	P10643	843 aa		9.13	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	IER5L	Q5T953	404 aa		9.11	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	METRN	Q9UJH8	293 aa		9.1	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GOLGA2	Q08379	1002 aa		9.09	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CABP2	Q9NPB3	220 aa		9.09	□□□□□ -0.95
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	9.07	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	STK25	O00506	426 aa		9.06	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	9.06	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POTEF	A5A3E0	1075 aa		9.05	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SEC24B	O95487	1268 aa		9.05	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	STK24	Q9Y6E0	443 aa		9.05	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POTEM	A6NI47	508 aa		9.04	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	9.04	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		9.03	□□□□□ -0.96
N4BP2L2-208	ENST00000483088	OTUD5	Q96G74	571 aa		9.02	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	OCEL1	Q9H607	264 aa		9.02	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	9.01	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		9.01	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POTEB2	H3BUK9	544 aa		9	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SOX12	O15370	315 aa		9	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		9	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PLCG2	P16885	1265 aa		9	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	9	□□□□□ -0.97	8e-10	■■□□□ 11.6
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POTEG	Q6S5H5	508 aa		8.99	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	8.99	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	8.97	□□□□□ -0.97
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		8.95	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	POTEJ	P0CG39	1038 aa		8.94	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		8.94	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NLRP6	P59044	892 aa		8.93	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		8.92	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		8.92	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MFRP	Q9BY79	579 aa		8.92	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	8.9	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		8.9	□□□□□ -0.98
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		8.89	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	8.88	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		8.86	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		8.85	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		8.85	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088		G3V3G9	751 aa		8.84	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	8.84	□□□□□ -0.99
N4BP2L2-208	ENST00000483088	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	8.82	□□□□□ -1
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	8.82	□□□□□ -1
N4BP2L2-208	ENST00000483088	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	8.81	□□□□□ -1
N4BP2L2-208	ENST00000483088	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	8.8	□□□□□ -1
N4BP2L2-208	ENST00000483088	PPP1R37	O75864	691 aa		8.8	□□□□□ -1
N4BP2L2-208	ENST00000483088	MICALL2	Q8IY33	904 aa		8.8	□□□□□ -1
N4BP2L2-208	ENST00000483088	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		8.79	□□□□□ -1

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms