RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.88■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EEA1Q15075 1411 aa22.87■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.86■■□□□ 1.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA3Q08378 1498 aa22.82■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNH8Q96L42 1107 aa22.8■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.249e-7■■■□□ 14.8
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.78■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPY4P0CV99 314 aa22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TSPY10P0CW01 314 aa22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.77■■□□□ 1.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMARCA2P51531 1590 aa22.76■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.74■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.72■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BECN1Q14457 450 aa22.71■■□□□ 1.23
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP162Q5TB80 1403 aa22.7■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.65■■□□□ 1.22
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.64■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CUX2O14529 1486 aa22.64■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.62■■□□□ 1.21
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.57■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.56■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.56■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WIZO95785 1651 aa22.56■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOGA1O94964 1423 aa22.54■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ABCC8Q09428 1581 aa22.5■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.47■■□□□ 1.19
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.45■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMARCA4P51532 1647 aa22.39■■□□□ 1.18
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.33■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGS3P49796 1198 aa22.32■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.31■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CASC1Q6TDU7 716 aa22.31■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.3■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.29■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGL3Q3MIN7 710 aa22.29■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFAP53Q96M91 514 aa22.28■■□□□ 1.16
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEUROD2Q15784 382 aa22.22■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDCA8Q53HL2 280 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa22.21■■□□□ 1.15
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.17■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLCB2Q00722 1185 aa22.17■■□□□ 1.14
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C14orf37Q86TY3 774 aa22.13■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHG5O94827 1062 aa22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.11■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0G2JS52 829 aa22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSCBQ8IWL3 235 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCER2I3L3R5 266 aa22.06■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.05■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUDCQ9Y266 331 aa22.04■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.03■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MS4A1P11836 297 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MLECQ14165 292 aa22.02■■□□□ 1.12
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
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