RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
GCFC2-208	ENST00000472230	HRC	P23327	699 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GCFC2-208	ENST00000472230	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GCFC2-208	ENST00000472230	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GCFC2-208	ENST00000472230	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GCFC2-208	ENST00000472230	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GCFC2-208	ENST00000472230	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.08	■■■□□ 2.09
GCFC2-208	ENST00000472230	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.06	■■■□□ 2.08
GCFC2-208	ENST00000472230	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.04	■■■□□ 2.08
GCFC2-208	ENST00000472230	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28	■■■□□ 2.07
GCFC2-208	ENST00000472230	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07
GCFC2-208	ENST00000472230	IQGAP2	Q13576	1575 aa		27.97	■■■□□ 2.07
GCFC2-208	ENST00000472230	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
GCFC2-208	ENST00000472230	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.95	■■■□□ 2.06
GCFC2-208	ENST00000472230	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GCFC2-208	ENST00000472230	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
GCFC2-208	ENST00000472230	FMN1	Q68DA7	1419 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GCFC2-208	ENST00000472230	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.92	■■■□□ 2.06
GCFC2-208	ENST00000472230	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.91	■■■□□ 2.06
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
GCFC2-208	ENST00000472230	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GCFC2-208	ENST00000472230	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		27.88	■■■□□ 2.05
GCFC2-208	ENST00000472230	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		27.87	■■■□□ 2.05
GCFC2-208	ENST00000472230	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		27.84	■■■□□ 2.05
GCFC2-208	ENST00000472230	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
GCFC2-208	ENST00000472230	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		27.8	■■■□□ 2.04
GCFC2-208	ENST00000472230	FBLN2	P98095	1184 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GCFC2-208	ENST00000472230	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.79	■■■□□ 2.04
GCFC2-208	ENST00000472230	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.73	■■■□□ 2.03
GCFC2-208	ENST00000472230	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
GCFC2-208	ENST00000472230	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.69	■■■□□ 2.02
GCFC2-208	ENST00000472230	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
GCFC2-208	ENST00000472230	KIAA0556	O60303	1618 aa		27.68	■■■□□ 2.02
GCFC2-208	ENST00000472230	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
GCFC2-208	ENST00000472230	NUP160	Q12769	1436 aa		27.66	■■■□□ 2.02
GCFC2-208	ENST00000472230	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.65	■■■□□ 2.02
GCFC2-208	ENST00000472230	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.64	■■■□□ 2.01
GCFC2-208	ENST00000472230	DISP1	Q96F81	1524 aa		27.63	■■■□□ 2.01
GCFC2-208	ENST00000472230	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.62	■■■□□ 2.01
GCFC2-208	ENST00000472230	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.59	■■■□□ 2.01
GCFC2-208	ENST00000472230	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.57	■■■□□ 2
GCFC2-208	ENST00000472230	CHD1	O14646	1710 aa		27.55	■■■□□ 2
GCFC2-208	ENST00000472230	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.54	■■■□□ 2
GCFC2-208	ENST00000472230	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		27.53	■■■□□ 2
GCFC2-208	ENST00000472230	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.52	■■■□□ 2
GCFC2-208	ENST00000472230	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.5	■■□□□ 1.99
GCFC2-208	ENST00000472230	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	27.49	■■□□□ 1.99
GCFC2-208	ENST00000472230	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
GCFC2-208	ENST00000472230	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.47	■■□□□ 1.99
GCFC2-208	ENST00000472230	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.42	■■□□□ 1.98
GCFC2-208	ENST00000472230	ITGAE	P38570	1179 aa		27.41	■■□□□ 1.98
GCFC2-208	ENST00000472230	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.41	■■□□□ 1.98
GCFC2-208	ENST00000472230	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.4	■■□□□ 1.98
GCFC2-208	ENST00000472230	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.38	■■□□□ 1.97
GCFC2-208	ENST00000472230	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
GCFC2-208	ENST00000472230	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.36	■■□□□ 1.97
GCFC2-208	ENST00000472230	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.34	■■□□□ 1.97
GCFC2-208	ENST00000472230	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.33	■■□□□ 1.97
GCFC2-208	ENST00000472230	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.32	■■□□□ 1.96
GCFC2-208	ENST00000472230	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.31	■■□□□ 1.96
GCFC2-208	ENST00000472230	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		27.3	■■□□□ 1.96
GCFC2-208	ENST00000472230	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.29	■■□□□ 1.96
GCFC2-208	ENST00000472230	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
GCFC2-208	ENST00000472230	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.26	■■□□□ 1.95
GCFC2-208	ENST00000472230	ABCA8	O94911	1581 aa		27.23	■■□□□ 1.95
GCFC2-208	ENST00000472230	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.21	■■□□□ 1.95
GCFC2-208	ENST00000472230	PTPRG	P23470	1445 aa		27.2	■■□□□ 1.94
GCFC2-208	ENST00000472230	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		27.17	■■□□□ 1.94
GCFC2-208	ENST00000472230	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.15	■■□□□ 1.94
GCFC2-208	ENST00000472230	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.14	■■□□□ 1.94
GCFC2-208	ENST00000472230	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		27.14	■■□□□ 1.94
GCFC2-208	ENST00000472230	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	27.14	■■□□□ 1.93
GCFC2-208	ENST00000472230	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.13	■■□□□ 1.93
GCFC2-208	ENST00000472230	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	27.11	■■□□□ 1.93
GCFC2-208	ENST00000472230	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		27.1	■■□□□ 1.93
GCFC2-208	ENST00000472230	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		27.08	■■□□□ 1.93
GCFC2-208	ENST00000472230	ATP10B	O94823	1461 aa		27.07	■■□□□ 1.92
GCFC2-208	ENST00000472230	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.06	■■□□□ 1.92
GCFC2-208	ENST00000472230	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.05	■■□□□ 1.92
GCFC2-208	ENST00000472230	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.04	■■□□□ 1.92
GCFC2-208	ENST00000472230	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.03	■■□□□ 1.92
GCFC2-208	ENST00000472230	KIF14	Q15058	1648 aa		27.01	■■□□□ 1.91
GCFC2-208	ENST00000472230	PTPRK	Q15262	1439 aa		27	■■□□□ 1.91
GCFC2-208	ENST00000472230	HFM1	A2PYH4	1435 aa		26.96	■■□□□ 1.91
GCFC2-208	ENST00000472230	ABCC2	Q92887	1545 aa		26.94	■■□□□ 1.9
GCFC2-208	ENST00000472230	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	26.91	■■□□□ 1.9
GCFC2-208	ENST00000472230	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	26.91	■■□□□ 1.9
GCFC2-208	ENST00000472230	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	26.89	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	NAIP	Q13075	1403 aa		26.88	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		26.87	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		26.87	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		26.86	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		26.86	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	DAPK1	P53355	1430 aa		26.86	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		26.85	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	AKNA	Q7Z591	1439 aa		26.85	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	26.84	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	MAPKBP1	O60336	1514 aa		26.83	■■□□□ 1.89
GCFC2-208	ENST00000472230	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		26.83	■■□□□ 1.89

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