RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NBR1Q14596 966 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GSE1Q14687 1217 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NACADO15069 1562 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NUBP1P53384 320 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VGFO15240 615 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STK25O00506 426 aa16.01■□□□□ 0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM212AQ96EL1 285 aa16.01■□□□□ 0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16■□□□□ 0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SCRIBQ14160 1630 aa15.97■□□□□ 0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CREBZFQ9NS37 354 aa15.89■□□□□ 0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BICRAQ9NZM4 1560 aa15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 STK24Q9Y6E0 443 aa15.85■□□□□ 0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR29P0C7W0 189 aa15.84■□□□□ 0.13
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKT1S1Q96B36 256 aa15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RASEFQ8IZ41 740 aa15.81■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.8■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P3H3Q8IVL6 736 aa15.78■□□□□ 0.12
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa15.73■□□□□ 0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.72■□□□□ 0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYGBP11216 843 aa15.71■□□□□ 0.11
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.69■□□□□ 0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM132AQ24JP5 1023 aa15.66■□□□□ 0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WDR70Q9NW82 654 aa15.62■□□□□ 0.09
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.56■□□□□ 0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.53■□□□□ 0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.08
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PITPNM1O00562 1244 aa15.45■□□□□ 0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MFRPQ9BY79 579 aa15.39■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.38■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.37■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PSEN1P49768 467 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARXQ96QS3 562 aa15.36■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C14orf37Q86TY3 774 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 E2F4Q16254 413 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHADLQ6NUI6 762 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NLRP6P59044 892 aa15.25■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PPP1R37O75864 691 aa15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FBXO22Q8NEZ5 403 aa15.23■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SOX12O15370 315 aa15.22■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMARCA4P51532 1647 aa15.21■□□□□ 0.03
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SEMA3EO15041 775 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.18■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.17■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NEUROD2Q15784 382 aa15.16■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IFNL1Q8IU54 200 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CABP2Q9NPB3 220 aa15.15■□□□□ 0.02
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHF8Q9UPP1 1060 aa15.14■□□□□ 0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.13■□□□□ 0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMYD5Q6GMV2 418 aa15.12■□□□□ 0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.11■□□□□ 0.01
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PDE4AP27815 886 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.08■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZMYND10O75800 440 aa15.07■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MAP3K13O43283 966 aa15.06■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MFSD10Q14728 455 aa15.06■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HOMEZQ8IX15 550 aa15.05■□□□□ -0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIF12Q96FN5 646 aa15.05■□□□□ -0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SMARCA2P51531 1590 aa15.04■□□□□ -0
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NCAPD3P42695 1498 aa15.04■□□□□ -0
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