RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
USP46-201ENST00000441222 CDCA8Q53HL2 280 aa8.73□□□□□ -1.01
USP46-201ENST00000441222 ARID3CA6NKF2 412 aa8.73□□□□□ -1.01
USP46-201ENST00000441222 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
USP46-201ENST00000441222 CFAP53Q96M91 514 aa8.72□□□□□ -1.01
USP46-201ENST00000441222 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa8.7□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 A0A0G2JS52 829 aa8.7□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.68□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 MS4A1P11836 297 aa8.68□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 CFAP44Q96MT7 982 aa8.67□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.67□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa8.66□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
USP46-201ENST00000441222 C14orf37Q86TY3 774 aa8.65□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 KNSTRNQ9Y448 316 aa8.63□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 NUDCQ9Y266 331 aa8.63□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 FGD1P98174 961 aa8.62□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.61□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa8.6□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 GOLGA2Q08379 1002 aa8.6□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa8.6□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 NPHP1O15259 732 aa8.6□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 ZBTB7CA1YPR0 619 aa8.59□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 KCNJ4P48050 445 aa8.59□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 PTMSP20962 102 aa8.59□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 SCRIBQ14160 1630 aa8.59□□□□□ -1.03
USP46-201ENST00000441222 MCCP23508 829 aa8.59□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.58□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 PLCB2Q00722 1185 aa8.57□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 USP35Q9P2H5 1018 aa8.56□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.55□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 EEA1Q15075 1411 aa8.55□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 HSCBQ8IWL3 235 aa8.55□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.53□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.53□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 CLIP1P30622 1438 aa8.53□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 CCDC34Q96HJ3 373 aa8.52□□□□□ -1.04
USP46-201ENST00000441222 HDGFP51858 240 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 DRC7Q8IY82 874 aa8.52□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa8.51□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 MIER1Q8N108 512 aa8.51□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 POGKQ9P215 609 aa8.51□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 CARD11Q9BXL7 1154 aa8.5□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 GOLGA3Q08378 1498 aa8.49□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 CLSTN1O94985 981 aa8.48□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 RGL3Q3MIN7 710 aa8.48□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 TPM4P67936 248 aa8.48□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 PLEKHG5O94827 1062 aa8.48□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 GBP4Q96PP9 640 aa8.47□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 KANK1Q14678 1352 aa8.47□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.47□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 RGS3P49796 1198 aa8.46□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa8.46□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
USP46-201ENST00000441222 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.46□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 TMF1P82094 1093 aa8.45□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 KCNH8Q96L42 1107 aa8.45□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.45□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 NEUROD2Q15784 382 aa8.44□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.43□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 GPATCH3Q96I76 525 aa8.43□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
USP46-201ENST00000441222 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa8.42□□□□□ -1.06
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