RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420309.5

PCBP1-AS1-216, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.21□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MSH5O43196 834 aa8.16□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CLSTN1O94985 981 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TICAM2Q86XR7 235 aa8.14□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ABCC9O60706 1549 aa8.13□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.11□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ERICH6BQ5W0A0 696 aa8.1□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RSPH6AQ9H0K4 717 aa8.1□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CFAP44Q96MT7 982 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PSMD1Q99460 953 aa8.08□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa8.04□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.04□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZMYND15Q9H091 742 aa8.03□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DNAJC5BQ9UF47 199 aa8.03□□□□□ -1.12
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SETQ01105 290 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 AAMPQ13685 434 aa8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PTMSP20962 102 aa7.99□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF592Q92610 1267 aa7.99□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NECTIN2Q92692 538 aa7.99□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RAD21O60216 631 aa7.98□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.97□□□□□ -1.13
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RGS22Q8NE09 1264 aa7.94□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.91□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.9□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.9□□□□□ -1.14
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NACADO15069 1562 aa7.89□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RBM25P49756 843 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CERS3Q8IU89 383 aa7.89□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TRIM41Q8WV44 630 aa7.88□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 USP35Q9P2H5 1018 aa7.88□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 E9PSI1 815 aa7.87□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TEX2Q8IWB9 1127 aa7.87□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 BRPF3Q9ULD4 1205 aa7.87□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MCCP23508 829 aa7.86□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PKD2Q13563 968 aa7.86□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TMCO4Q5TGY1 634 aa7.86□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MTMR7Q9Y216 660 aa7.86□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DMRT2Q9Y5R5 561 aa7.86□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NEFMP07197 916 aa7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CANXP27824 592 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 RBM10P98175 930 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.84□□□□□ -1.15
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MAFGO15525 162 aa7.83□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PTMAP06454 111 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 NEUROD2Q15784 382 aa7.81□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.81□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TRAIPQ9BWF2 469 aa7.81□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FANCIQ9NVI1 1328 aa7.8□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 SLC4A2P04920 1241 aa7.8□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC27Q2M243 656 aa7.8□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 CCDC125Q86Z20 511 aa7.79□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa7.78□□□□□ -1.16
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ANAPC15P60006 121 aa7.77□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 APBB1O00213 710 aa7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.73□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.73□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 GPATCH11Q8N954 259 aa7.73□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF428Q96B54 188 aa7.73□□□□□ -1.17
PCBP1-AS1-216ENST00000420309 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms