RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 METRNQ9UJH8 293 aa9.69□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.67□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa9.66□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPDYE4A6NLX3 237 aa9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLC39A7Q92504 469 aa9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.62□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C7P10643 843 aa9.61□□□□□ -0.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAMSTRQ6ZN01 415 aa9.55□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 POTEFA5A3E0 1075 aa9.54□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.51□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRPC6Q9Y210 931 aa9.49□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MYO15BQ96JP2 1530 aa9.48□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF12Q96FN5 646 aa9.46□□□□□ -0.9
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MAP3K13O43283 966 aa9.39□□□□□ -0.91
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TIE1P35590 1138 aa9.37□□□□□ -0.91
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.37□□□□□ -0.91
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PROM2Q8N271 834 aa9.36□□□□□ -0.91
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.35□□□□□ -0.91
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RASEFQ8IZ41 740 aa9.33□□□□□ -0.92
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa9.33□□□□□ -0.92
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SEC24BO95487 1268 aa9.31□□□□□ -0.92
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ST18O60284 1047 aa9.28□□□□□ -0.92
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.28□□□□□ -0.92
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IER5LQ5T953 404 aa9.25□□□□□ -0.93
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SLAIN1Q8ND83 568 aa9.24□□□□□ -0.93
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NACADO15069 1562 aa9.22□□□□□ -0.93
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.21□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.2□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MMRN1Q13201 1228 aa9.19□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MIER1Q8N108 512 aa9.19□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IFNL1Q8IU54 200 aa9.18□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.18□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.16□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLEKHG5O94827 1062 aa9.15□□□□□ -0.94
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLCG2P16885 1265 aa9.13□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM106CQ9BVX2 250 aa9.13□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ABCC9O60706 1549 aa9.12□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUBP1P53384 320 aa9.12□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MARVELD3Q96A59 401 aa9.09□□□□□ -0.95
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLCD3Q8N3E9 789 aa9.07□□□□□ -0.96
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OCEL1Q9H607 264 aa9.03□□□□□ -0.96
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.03□□□□□ -0.96
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SNPHO15079 494 aa9.01□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM212AQ96EL1 285 aa9.01□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FKBP8Q14318 412 aa9□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCRIBQ14160 1630 aa9□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.98□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.98□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 POTEB3A0JP26 581 aa8.97□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 POTEBQ6S5H4 581 aa8.97□□□□□ -0.97
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PYGBP11216 843 aa8.95□□□□□ -0.98
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EMP3P54852 163 aa8.95□□□□□ -0.98
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.95□□□□□ -0.98
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.92□□□□□ -0.98
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM205CA6NFA0 338 aa8.89□□□□□ -0.99
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.89□□□□□ -0.99
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.88□□□□□ -0.99
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.82□□□□□ -1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CECR2Q9BXF3 1484 aa8.82□□□□□ -1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GOLGA2Q08379 1002 aa8.77□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.76□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FBXO3Q9UK99 471 aa8.75□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PEG3Q9GZU2 1588 aa8.74□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMARCA4P51532 1647 aa8.74□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PSEN1P49768 467 aa8.73□□□□□ -1.01
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BICRAQ9NZM4 1560 aa8.7□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WIZO95785 1651 aa8.7□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRIM41Q8WV44 630 aa8.7□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UNC13AQ9UPW8 1703 aa8.69□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GSE1Q14687 1217 aa8.68□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERBB3P21860 1342 aa8.67□□□□□ -1.02
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms