RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC39A7Q92504 469 aa8.64□□□□□ -1.03
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C7P10643 843 aa8.63□□□□□ -1.03
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.59□□□□□ -1.03
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHF12Q96QT6 1004 aa8.58□□□□□ -1.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FKBP8Q14318 412 aa8.49□□□□□ -1.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.44□□□□□ -1.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ST18O60284 1047 aa8.43□□□□□ -1.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.42□□□□□ -1.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CREBZFQ9NS37 354 aa8.4□□□□□ -1.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEFA5A3E0 1075 aa8.35□□□□□ -1.07
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.3□□□□□ -1.08
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEC24BO95487 1268 aa8.28□□□□□ -1.08
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLCB2Q00722 1185 aa8.25□□□□□ -1.09
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MARVELD3Q96A59 401 aa8.23□□□□□ -1.09
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 STAG3Q9UJ98 1225 aa8.19□□□□□ -1.1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNPHO15079 494 aa8.13□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TIE1P35590 1138 aa8.12□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.12□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.12□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRPC6Q9Y210 931 aa8.11□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EMP3P54852 163 aa8.1□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BCANQ96GW7 911 aa8.09□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.09□□□□□ -1.11
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IER5LQ5T953 404 aa8.07□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIF12Q96FN5 646 aa8.07□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC61Q9Y6R9 512 aa8.05□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VSIG10Q8N0Z9 540 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.03□□□□□ -1.12
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM205CA6NFA0 338 aa8.02□□□□□ -1.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEB3A0JP26 581 aa8□□□□□ -1.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEBQ6S5H4 581 aa8□□□□□ -1.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLCG2P16885 1265 aa7.99□□□□□ -1.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PROM2Q8N271 834 aa7.99□□□□□ -1.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAP3K13O43283 966 aa7.98□□□□□ -1.13
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBXO3Q9UK99 471 aa7.96□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.95□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PKD2Q13563 968 aa7.93□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.9□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.9□□□□□ -1.14
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYE4A6NLX3 237 aa7.84□□□□□ -1.15
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OCEL1Q9H607 264 aa7.81□□□□□ -1.16
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.8□□□□□ -1.16
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.78□□□□□ -1.16
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.78□□□□□ -1.16
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.77□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.75□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.73□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.73□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERBB3P21860 1342 aa7.73□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTGER2P43116 358 aa7.72□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RASEFQ8IZ41 740 aa7.71□□□□□ -1.18
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IFNL1Q8IU54 200 aa7.7□□□□□ -1.18
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa7.7□□□□□ -1.18
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CFAP44Q96MT7 982 aa7.65□□□□□ -1.18
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.64□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARXQ96QS3 562 aa7.64□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.62□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RGL2O15211 777 aa7.61□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLEKHG5O94827 1062 aa7.61□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPOCK2Q92563 424 aa7.61□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa7.61□□□□□ -1.19
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.58□□□□□ -1.2
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF687Q8N1G0 1237 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DOK7Q18PE1 504 aa7.53□□□□□ -1.2
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HCSTQ9UBK5 93 aa7.52□□□□□ -1.21
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERICH6Q7L0X2 663 aa7.51□□□□□ -1.21
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