RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.34■■□□□ 1.01
SH3BP4-203ENST00000409212 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP4-203ENST00000409212 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP4-203ENST00000409212 KCNH8Q96L42 1107 aa21.31■■□□□ 1
SH3BP4-203ENST00000409212 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.29■■□□□ 1
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.27■■□□□ 1
SH3BP4-203ENST00000409212 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-203ENST00000409212 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4-203ENST00000409212 MIER1Q8N108 512 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-203ENST00000409212 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 RGL3Q3MIN7 710 aa21.14■□□□□ 0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.14■□□□□ 0.98
SH3BP4-203ENST00000409212 CDCA8Q53HL2 280 aa21.13■□□□□ 0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 ERCC6Q03468 1493 aa21.09■□□□□ 0.97
SH3BP4-203ENST00000409212 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.05■□□□□ 0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.04■□□□□ 0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 CFAP53Q96M91 514 aa21.03■□□□□ 0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.02■□□□□ 0.96
SH3BP4-203ENST00000409212 CUX2O14529 1486 aa21.01■□□□□ 0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21■□□□□ 0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
SH3BP4-203ENST00000409212 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 SOGA1O94964 1423 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 C14orf37Q86TY3 774 aa20.95■□□□□ 0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 SIN3AQ96ST3 1273 aa20.93■□□□□ 0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.91■□□□□ 0.94
SH3BP4-203ENST00000409212 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.88■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 SMARCA2P51531 1590 aa20.85■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 VPS8Q8N3P4 1428 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 POGKQ9P215 609 aa20.84■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 NUDCQ9Y266 331 aa20.83■□□□□ 0.93
SH3BP4-203ENST00000409212 KANK1Q14678 1352 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 A0A0G2JS52 829 aa20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 PLEKHG5O94827 1062 aa20.8■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 BECN1Q14457 450 aa20.79■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 NBR1Q14596 966 aa20.78■□□□□ 0.92
SH3BP4-203ENST00000409212 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 TMF1P82094 1093 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.76■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
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SH3BP4-203ENST00000409212 NEUROD2Q15784 382 aa20.72■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCC8Q09428 1581 aa20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
SH3BP4-203ENST00000409212 FMN1Q68DA7 1419 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.66■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 MS4A1P11836 297 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
SH3BP4-203ENST00000409212 PKD2Q13563 968 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 CASC1Q6TDU7 716 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 ARXQ96QS3 562 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 NCLP19338 710 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 CCER2I3L3R5 266 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 LMOD2Q6P5Q4 547 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-203ENST00000409212 GGT6Q6P531 493 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 MLECQ14165 292 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 MPHOSPH9Q99550 1183 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 MORC1Q86VD1 984 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 NUP155O75694 1391 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-203ENST00000409212 WIZO95785 1651 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 RGS3P49796 1198 aa20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 FOXD1Q16676 465 aa20.49■□□□□ 0.87
SH3BP4-203ENST00000409212 TRHP20396 242 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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