RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-201ENST00000344528 MRS2Q9HD23 443 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-201ENST00000344528 FKBP8Q14318 412 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-201ENST00000344528 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-201ENST00000344528 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-201ENST00000344528 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 RGL3Q3MIN7 710 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 CUX2O14529 1486 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
SH3BP4-201ENST00000344528 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CDCA8Q53HL2 280 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4-201ENST00000344528 SMARCA2P51531 1590 aa21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 MIER1Q8N108 512 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 C14orf37Q86TY3 774 aa21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SOGA1O94964 1423 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.71■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.7■■□□□ 1.07
SH3BP4-201ENST00000344528 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-201ENST00000344528 CFAP53Q96M91 514 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP4-201ENST00000344528 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP4-201ENST00000344528 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-201ENST00000344528 KANK1Q14678 1352 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 POGKQ9P215 609 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JS52 829 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHG5O94827 1062 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP4-201ENST00000344528 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCC8Q09428 1581 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 NUDCQ9Y266 331 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 FMN1Q68DA7 1419 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.45■■□□□ 1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TMF1P82094 1093 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-201ENST00000344528 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 MLECQ14165 292 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 GGT6Q6P531 493 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 PKD2Q13563 968 aa21.35■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 NEUROD2Q15784 382 aa21.33■■□□□ 1.01
SH3BP4-201ENST00000344528 WIZO95785 1651 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.32■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.3■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
SH3BP4-201ENST00000344528 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 BECN1Q14457 450 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP155O75694 1391 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.25■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 MS4A1P11836 297 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 ARXQ96QS3 562 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 JPH4Q96JJ6 628 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP4-201ENST00000344528 SMARCA4P51532 1647 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 MORC1Q86VD1 984 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 CASC1Q6TDU7 716 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXD1Q16676 465 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP4-201ENST00000344528 NBR1Q14596 966 aa21.16■□□□□ 0.98
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