RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324333.14

GLIS3-201, Transcript of GLIS family zinc finger 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GLIS3, Length 6,667 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS3-201ENST00000324333 CLIP1P30622 1438 aa18.43■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 A0A0G2JS52 829 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 CCDC136Q96JN2 1154 aa18.41■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.4■□□□□ 0.54
GLIS3-201ENST00000324333 RGL3Q3MIN7 710 aa18.38■□□□□ 0.53
GLIS3-201ENST00000324333 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
GLIS3-201ENST00000324333 C14orf37Q86TY3 774 aa18.34■□□□□ 0.53
GLIS3-201ENST00000324333 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
GLIS3-201ENST00000324333 CEP162Q5TB80 1403 aa18.3■□□□□ 0.52
GLIS3-201ENST00000324333 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.3■□□□□ 0.52
GLIS3-201ENST00000324333 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.27■□□□□ 0.52
GLIS3-201ENST00000324333 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.52
GLIS3-201ENST00000324333 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.27■□□□□ 0.51
GLIS3-201ENST00000324333 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
GLIS3-201ENST00000324333 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
GLIS3-201ENST00000324333 GOLGA3Q08378 1498 aa18.25■□□□□ 0.51
GLIS3-201ENST00000324333 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
GLIS3-201ENST00000324333 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.17■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.17■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
GLIS3-201ENST00000324333 NEUROD2Q15784 382 aa18.13■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.13■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.1■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.09■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
GLIS3-201ENST00000324333 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 ERCC6Q03468 1493 aa18.06■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 KIF27Q86VH2 1401 aa18.06■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.04■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
GLIS3-201ENST00000324333 LMOD2Q6P5Q4 547 aa18.01■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.01■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 DDRGK1Q96HY6 314 aa18■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 EEA1Q15075 1411 aa17.99■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.98■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 NACADO15069 1562 aa17.98■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 CECR2Q9BXF3 1484 aa17.97■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 CFAP53Q96M91 514 aa17.96■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.96■□□□□ 0.47
GLIS3-201ENST00000324333 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 POGKQ9P215 609 aa17.95■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 SOGA1O94964 1423 aa17.95■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 MLECQ14165 292 aa17.95■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 SOX12O15370 315 aa17.93■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 NCLP19338 710 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.92■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 FOXD1Q16676 465 aa17.92■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 BECN1Q14457 450 aa17.91■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 DCAF11Q8TEB1 546 aa17.91■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 ABCC8Q09428 1581 aa17.9■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 RGS3P49796 1198 aa17.9■□□□□ 0.46
GLIS3-201ENST00000324333 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.88■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 CCNB3Q8WWL7 1395 aa17.88■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 CUX2O14529 1486 aa17.88■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 CDCA8Q53HL2 280 aa17.87■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.86■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.85■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
GLIS3-201ENST00000324333 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa17.83■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP17.82■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 STK26Q9P289 416 aa17.79■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 NUDCQ9Y266 331 aa17.78■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 CASC1Q6TDU7 716 aa17.77■□□□□ 0.44
GLIS3-201ENST00000324333 GGT6Q6P531 493 aa17.75■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 TMF1P82094 1093 aa17.74■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.74■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 NPHP1O15259 732 aa17.74■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.74■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.73■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 FHAD1B1AJZ9 1412 aa17.72■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa17.72■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 MROH2BQ7Z745 1585 aa17.71■□□□□ 0.43
GLIS3-201ENST00000324333 PKD2Q13563 968 aa17.7■□□□□ 0.42
GLIS3-201ENST00000324333 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa17.7■□□□□ 0.42
GLIS3-201ENST00000324333 KANK1Q14678 1352 aa17.7■□□□□ 0.42
GLIS3-201ENST00000324333 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
GLIS3-201ENST00000324333 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
GLIS3-201ENST00000324333 MORC1Q86VD1 984 aa17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms