RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299598.11

PKD1L2-201, Transcript of polycystin 1 like 2 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene PKD1L2, Length 5,818 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L2-201ENST00000299598 FKBP8Q14318 412 aa15.34■□□□□ 0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 GOLGA3Q08378 1498 aa15.34■□□□□ 0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 C14orf37Q86TY3 774 aa15.34■□□□□ 0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 NBR1Q14596 966 aa15.31■□□□□ 0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.3■□□□□ 0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 CUX2O14529 1486 aa15.24■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 PLEKHG5O94827 1062 aa15.24■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 A0A0G2JS52 829 aa15.23■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.23■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 FAM9BQ8IZU0 186 aa15.23■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 SMARCA2P51531 1590 aa15.22■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 CEP162Q5TB80 1403 aa15.22■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.22■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 ZBTB7CA1YPR0 619 aa15.21■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 RGL3Q3MIN7 710 aa15.21■□□□□ 0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP15.2■□□□□ 0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 TMC1Q8TDI8 760 aa15.14■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.14■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.14■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 MLECQ14165 292 aa15.14■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CCNB3Q8WWL7 1395 aa15.14■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 SOGA1O94964 1423 aa15.13■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.12■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.12■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.1■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.09■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.09■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.09■□□□□ 0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.07■□□□□ 0
PKD1L2-201ENST00000299598 POGKQ9P215 609 aa15.05■□□□□ -0
PKD1L2-201ENST00000299598 LMOD2Q6P5Q4 547 aa15.04■□□□□ -0
PKD1L2-201ENST00000299598 KANK1Q14678 1352 aa15.04■□□□□ -0
PKD1L2-201ENST00000299598 CDCA8Q53HL2 280 aa15.03■□□□□ -0
PKD1L2-201ENST00000299598 HDGFP51858 240 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PKD1L2-201ENST00000299598 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 MRS2Q9HD23 443 aa15.01□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.01□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 GGT6Q6P531 493 aa15□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.99□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.99□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.97□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.96□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 CFAP53Q96M91 514 aa14.96□□□□□ -0.01
PKD1L2-201ENST00000299598 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa14.95□□□□□ -0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 KNSTRNQ9Y448 316 aa14.95□□□□□ -0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 ABCC8Q09428 1581 aa14.92□□□□□ -0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 JPH4Q96JJ6 628 aa14.9□□□□□ -0.02
PKD1L2-201ENST00000299598 OSCARQ8IYS5 282 aa14.89□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 NCLP19338 710 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.87□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 FMN1Q68DA7 1419 aa14.87□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.86□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 WIZO95785 1651 aa14.86□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 MYH16Q9H6N6 1097 aa14.86□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.85□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 MIER1Q8N108 512 aa14.84□□□□□ -0.03
PKD1L2-201ENST00000299598 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.83□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 NUDCQ9Y266 331 aa14.83□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.83□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.81□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.8□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 KIF3BO15066 747 aa14.8□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.8□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SMARCA4P51532 1647 aa14.8□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PKD2Q13563 968 aa14.79□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 STK26Q9P289 416 aa14.79□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.78□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 TMF1P82094 1093 aa14.78□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 SOX12O15370 315 aa14.77□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PKD1L2-201ENST00000299598 NPHP1O15259 732 aa14.76□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.76□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 NEUROD2Q15784 382 aa14.76□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 BECN1Q14457 450 aa14.75□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PKD1L2-201ENST00000299598 PTPRGP23470 1445 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms