RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278520.9

CCDC82-201, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC82, Length 2,941 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-201ENST00000278520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 DCAF8Q5TAQ9 597 aa6.84□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCDC82-201ENST00000278520 RASEFQ8IZ41 740 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 GSE1Q14687 1217 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 CFAP44Q96MT7 982 aa6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 TRIM41Q8WV44 630 aa6.81□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 CHADLQ6NUI6 762 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 FAM212AQ96EL1 285 aa6.8□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.79□□□□□ -1.32
CCDC82-201ENST00000278520 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.77□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 PYGBP11216 843 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.76□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.75□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 STK25O00506 426 aa6.71□□□□□ -1.33
CCDC82-201ENST00000278520 UNC13AQ9UPW8 1703 aa6.71□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 VGFO15240 615 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 STK24Q9Y6E0 443 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.66□□□□□ -1.34
CCDC82-201ENST00000278520 CHRDL2Q6WN34 429 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 BCANQ96GW7 911 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 CCDC61Q9Y6R9 512 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 ABCC9O60706 1549 aa6.65□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa6.64□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.63□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
CCDC82-201ENST00000278520 MAP3K13O43283 966 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 IFNL1Q8IU54 200 aa6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 PSEN1P49768 467 aa6.56□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 KIF12Q96FN5 646 aa6.55□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 BICRAQ9NZM4 1560 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 MFRPQ9BY79 579 aa6.53□□□□□ -1.36
CCDC82-201ENST00000278520 ZRANB1Q9UGI0 708 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 CADPS2Q86UW7 1296 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 PHF12Q96QT6 1004 aa6.52□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 EFCAB3Q8N7B9 438 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 CABP2Q9NPB3 220 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 PPP1R37O75864 691 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 TRPC6Q9Y210 931 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.47□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 PHF8Q9UPP1 1060 aa6.46□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 NBR1Q14596 966 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 C19orf67A6NJJ6 358 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 SOX12O15370 315 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 NLRP6P59044 892 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.4□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 EVX2Q03828 476 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 SMARCA2P51531 1590 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 WDR70Q9NW82 654 aa6.38□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa6.37□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 TTLL13PA6NNM8 815 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 GOLGA2Q08379 1002 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 P3H3Q8IVL6 736 aa6.36□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 SCRIBQ14160 1630 aa6.35□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 HAX1O00165 279 aa6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 HMGXB3Q12766 1538 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 TIE1P35590 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 E2F4Q16254 413 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.44e-7■■■■□ 25.4
CCDC82-201ENST00000278520 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 PRDM2Q13029 1718 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms