RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278520.9

CCDC82-201, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene CCDC82, Length 2,941 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-201ENST00000278520 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa6.85□□□□□ -1.31
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CCDC82-201ENST00000278520 MAP3K13O43283 966 aa6.57□□□□□ -1.36
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CCDC82-201ENST00000278520 PPP1R37O75864 691 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC82-201ENST00000278520 TRPC6Q9Y210 931 aa6.47□□□□□ -1.37
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CCDC82-201ENST00000278520 SOX12O15370 315 aa6.42□□□□□ -1.38
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CCDC82-201ENST00000278520 MS4A4AQ96JQ5 239 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 TMEM106CQ9BVX2 250 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.4□□□□□ -1.38
CCDC82-201ENST00000278520 EVX2Q03828 476 aa6.39□□□□□ -1.39
CCDC82-201ENST00000278520 SMARCA2P51531 1590 aa6.39□□□□□ -1.39
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CCDC82-201ENST00000278520 GOLGA2Q08379 1002 aa6.36□□□□□ -1.39
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CCDC82-201ENST00000278520 HMGXB3Q12766 1538 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 TIE1P35590 1138 aa6.33□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 E2F4Q16254 413 aa6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.31□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.44e-7■■■■□ 25.4
CCDC82-201ENST00000278520 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 PRDM2Q13029 1718 aa6.3□□□□□ -1.4
CCDC82-201ENST00000278520 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
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