RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
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USP22-201ENST00000261497 RGL3Q3MIN7 710 aa18.58■□□□□ 0.56
USP22-201ENST00000261497 EEA1Q15075 1411 aa18.56■□□□□ 0.56
USP22-201ENST00000261497 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
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USP22-201ENST00000261497 FKBP8Q14318 412 aa18.55■□□□□ 0.56
USP22-201ENST00000261497 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.55■□□□□ 0.56
USP22-201ENST00000261497 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
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USP22-201ENST00000261497 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.39■□□□□ 0.54
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USP22-201ENST00000261497 CEP164Q9UPV0 1460 aa18.36■□□□□ 0.53
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USP22-201ENST00000261497 STK26Q9P289 416 aa18.05■□□□□ 0.48
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USP22-201ENST00000261497 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.04■□□□□ 0.48
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USP22-201ENST00000261497 TMF1P82094 1093 aa18.01■□□□□ 0.47
USP22-201ENST00000261497 KIF3BO15066 747 aa18■□□□□ 0.47
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USP22-201ENST00000261497 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
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USP22-201ENST00000261497 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
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USP22-201ENST00000261497 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
USP22-201ENST00000261497 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.91■□□□□ 0.46
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USP22-201ENST00000261497 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
USP22-201ENST00000261497 NUP155O75694 1391 aa17.9■□□□□ 0.46
USP22-201ENST00000261497 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP17.9■□□□□ 0.464e-7■■■□□ 19.1
USP22-201ENST00000261497 MORC1Q86VD1 984 aa17.9■□□□□ 0.46
USP22-201ENST00000261497 ABCC8Q09428 1581 aa17.9■□□□□ 0.46
USP22-201ENST00000261497 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.89■□□□□ 0.45
USP22-201ENST00000261497 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
USP22-201ENST00000261497 BECN1Q14457 450 aa17.87■□□□□ 0.45
USP22-201ENST00000261497 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.87■□□□□ 0.45
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