RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220325.8

EHD4-201, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD4, Length 6,416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-201ENST00000220325 MRS2Q9HD23 443 aa19.08■□□□□ 0.64
EHD4-201ENST00000220325 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
EHD4-201ENST00000220325 NBR1Q14596 966 aa19.06■□□□□ 0.64
EHD4-201ENST00000220325 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.06■□□□□ 0.64
EHD4-201ENST00000220325 CCDC136Q96JN2 1154 aa19.05■□□□□ 0.64
EHD4-201ENST00000220325 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.04■□□□□ 0.64
EHD4-201ENST00000220325 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
EHD4-201ENST00000220325 TPRNQ4KMQ1 711 aa19■□□□□ 0.63
EHD4-201ENST00000220325 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
EHD4-201ENST00000220325 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
EHD4-201ENST00000220325 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.98■□□□□ 0.63
EHD4-201ENST00000220325 NEUROD2Q15784 382 aa18.94■□□□□ 0.62
EHD4-201ENST00000220325 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
EHD4-201ENST00000220325 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
EHD4-201ENST00000220325 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
EHD4-201ENST00000220325 MLECQ14165 292 aa18.89■□□□□ 0.61
EHD4-201ENST00000220325 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.88■□□□□ 0.61
EHD4-201ENST00000220325 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.87■□□□□ 0.61
EHD4-201ENST00000220325 SOX12O15370 315 aa18.86■□□□□ 0.61
EHD4-201ENST00000220325 MIER1Q8N108 512 aa18.86■□□□□ 0.61
EHD4-201ENST00000220325 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.81■□□□□ 0.6
EHD4-201ENST00000220325 NPHP1O15259 732 aa18.79■□□□□ 0.6
EHD4-201ENST00000220325 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
EHD4-201ENST00000220325 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
EHD4-201ENST00000220325 POGKQ9P215 609 aa18.74■□□□□ 0.59
EHD4-201ENST00000220325 CLIP1P30622 1438 aa18.73■□□□□ 0.59
EHD4-201ENST00000220325 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
EHD4-201ENST00000220325 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.7■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.7■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.67■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 CFAP53Q96M91 514 aa18.65■□□□□ 0.58
EHD4-201ENST00000220325 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
EHD4-201ENST00000220325 RGS3P49796 1198 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD4-201ENST00000220325 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD4-201ENST00000220325 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
EHD4-201ENST00000220325 ERCC6Q03468 1493 aa18.59■□□□□ 0.57
EHD4-201ENST00000220325 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
EHD4-201ENST00000220325 STK26Q9P289 416 aa18.57■□□□□ 0.56
EHD4-201ENST00000220325 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
EHD4-201ENST00000220325 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
EHD4-201ENST00000220325 GGT6Q6P531 493 aa18.55■□□□□ 0.56
EHD4-201ENST00000220325 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.52■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 PLCB2Q00722 1185 aa18.5■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 NUDCQ9Y266 331 aa18.48■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 FOXD1Q16676 465 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 CEP162Q5TB80 1403 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 GOLGA2Q08379 1002 aa18.47■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 FGD1P98174 961 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 CDCA8Q53HL2 280 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 BECN1Q14457 450 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 APBB1O00213 710 aa18.46■□□□□ 0.55
EHD4-201ENST00000220325 KCNJ4P48050 445 aa18.43■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 CASC1Q6TDU7 716 aa18.42■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.41■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.4■□□□□ 0.54
EHD4-201ENST00000220325 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.39■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.38■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 CLSTN1O94985 981 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 NUTM2FA1L443 756 aa18.37■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 GOLGA3Q08378 1498 aa18.36■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.36■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 CCNB3Q8WWL7 1395 aa18.35■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 KIF27Q86VH2 1401 aa18.33■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
EHD4-201ENST00000220325 MORC1Q86VD1 984 aa18.33■□□□□ 0.52
EHD4-201ENST00000220325 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.32■□□□□ 0.52
EHD4-201ENST00000220325 TMF1P82094 1093 aa18.29■□□□□ 0.52
EHD4-201ENST00000220325 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
EHD4-201ENST00000220325 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 PKD2Q13563 968 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa18.24■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 KANK1Q14678 1352 aa18.23■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.21■□□□□ 0.51
EHD4-201ENST00000220325 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
EHD4-201ENST00000220325 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
EHD4-201ENST00000220325 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms