RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000176667.7

Lrch4-204, Transcript of Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrch4, Length 2,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Setd5Q5XJV7 1441 aa27.38■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cux1P53564 1515 aa27.35■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Setd1bQ8CFT2 1985 aa27.35■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ankrd26Q811D2 1581 aa27.35■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa27.33■■□□□ 1.97
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gpatch8A2A6A1 1505 aa27.3■■□□□ 1.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rusc2Q80U22 1514 aa27.3■■□□□ 1.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rpap1Q80TE0 1409 aa27.28■■□□□ 1.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fyco1Q8VDC1 1437 aa27.28■■□□□ 1.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arap1Q4LDD4 1452 aa27.27■■□□□ 1.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Erich3F6QRE9 1637 aa27.27■■□□□ 1.96
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa27.23■■□□□ 1.95
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Adamts12Q811B3 1600 aa27.21■■□□□ 1.95
Lrch4-204ENSMUST00000176667 WizO88286 1684 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
Lrch4-204ENSMUST00000176667 CadpsQ80TJ1 1355 aa27.18■■□□□ 1.94
Lrch4-204ENSMUST00000176667 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa27.17■■□□□ 1.94
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa27.17■■□□□ 1.94
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa27.15■■□□□ 1.94
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Pcf11G3X9Z4 1553 aa27.13■■□□□ 1.93
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
Lrch4-204ENSMUST00000176667 PxdnQ3UQ28 1475 aa27.11■■□□□ 1.93
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Abca16E9PWJ7 1678 aa27.1■■□□□ 1.93
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Abca5Q8K448 1642 aa27.1■■□□□ 1.93
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa27.1■■□□□ 1.93
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Soga1E1U8D0 1418 aa27.06■■□□□ 1.92
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Aebp1Q640N1 1128 aa27.04■■□□□ 1.92
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Tiam1Q60610 1591 aa27.01■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgap27A2AB59 869 aa27.01■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 CntlnA2AM05 1397 aa26.99■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Abcc2Q8VI47 1543 aa26.98■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 BlmO88700 1416 aa26.97■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Naip1Q9QWK5 1403 aa26.97■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 UbtfP25976 765 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Slx4Q6P1D7 1565 aa26.92■■□□□ 1.9
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Lrch4-204ENSMUST00000176667 WrnO09053 1401 aa26.89■■□□□ 1.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fgd6Q69ZL1 1399 aa26.88■■□□□ 1.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Peg3Q3URU2 1571 aa26.86■■□□□ 1.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Shroom2A2ALU4 1481 aa26.86■■□□□ 1.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Map3k4O08648 1597 aa26.85■■□□□ 1.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kif27Q7M6Z4 1394 aa26.83■■□□□ 1.89
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Lmod2Q3UHZ5 550 aa26.82■■□□□ 1.88
Lrch4-204ENSMUST00000176667 AknaQ80VW7 1404 aa26.8■■□□□ 1.88
Lrch4-204ENSMUST00000176667 BC005561E9Q5E2 1589 aa26.76■■□□□ 1.87
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Neo1P97798 1493 aa26.76■■□□□ 1.87
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa26.75■■□□□ 1.87
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa26.65■■□□□ 1.86
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mier1Q5UAK0 511 aa26.65■■□□□ 1.86
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26.64■■□□□ 1.86
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa26.63■■□□□ 1.85
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Jph4Q80WT0 628 aa26.62■■□□□ 1.85
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Abcc1O35379 1528 aa26.58■■□□□ 1.85
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gm14025A2AP89 1413 aa26.58■■□□□ 1.85
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa26.56■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ncoa2Q61026 1462 aa26.55■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa26.53■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mug1P28665 1476 aa26.52■■□□□ 1.84
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ncoa3O09000 1398 aa26.5■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 NexmifQ5DTT1 1515 aa26.5■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgef11Q68FM7 1552 aa26.5■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa26.5■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ccnb3Q810T2 1396 aa26.48■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Chd1P40201 1711 aa26.48■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Magi1Q6RHR9 1471 aa26.44■■□□□ 1.82
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mroh2aD3Z750 1679 aa26.44■■□□□ 1.82
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Lrch4-204ENSMUST00000176667 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa26.41■■□□□ 1.82
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gcc2Q8CHG3 1679 aa26.39■■□□□ 1.81
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa26.37■■□□□ 1.81
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fam163aQ8CAA5 168 aa26.35■■□□□ 1.81
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa26.35■■□□□ 1.81
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kdm5bQ80Y84 1544 aa26.32■■□□□ 1.8
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Prex2Q3LAC4 1598 aa26.32■■□□□ 1.8
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa26.31■■□□□ 1.8
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fancd2Q80V62 1450 aa26.31■■□□□ 1.8
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa26.29■■□□□ 1.8
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
Lrch4-204ENSMUST00000176667 A2mQ6GQT1 1474 aa26.23■■□□□ 1.79
Lrch4-204ENSMUST00000176667 PtprtQ99M80 1454 aa26.22■■□□□ 1.79
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cul7Q8VE73 1689 aa26.21■■□□□ 1.79
Lrch4-204ENSMUST00000176667 NefmP08553 848 aa26.21■■□□□ 1.79
Lrch4-204ENSMUST00000176667 NhsB1AV60 1647 aa26.2■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Cep170Q6A065 1588 aa26.19■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Adcy10Q8C0T9 1614 aa26.18■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Arhgef40Q3UPH7 1517 aa26.17■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Naip2Q9QUK4 1447 aa26.16■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Igf1rQ60751 1373 aa26.15■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa26.14■■□□□ 1.78
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Mia2Q91ZV0 1396 aa26.14■■□□□ 1.77
Lrch4-204ENSMUST00000176667 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.6 ms