RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061745.4

Hoxd10-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd10, Length 1,816 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Rusc2Q80U22 1514 aa20.99■□□□□ 0.95
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20.93■□□□□ 0.94
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gpatch8A2A6A1 1505 aa20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 EprsQ8CGC7 1512 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Cux1P53564 1515 aa20.89■□□□□ 0.93
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ankrd26Q811D2 1581 aa20.86■□□□□ 0.93
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 WizO88286 1684 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Adamts12Q811B3 1600 aa20.82■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa20.81■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Abca16E9PWJ7 1678 aa20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Setd5Q5XJV7 1441 aa20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Eea1Q8BL66 1411 aa20.8■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 PxdnQ3UQ28 1475 aa20.79■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 CadpsQ80TJ1 1355 aa20.77■□□□□ 0.92
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Rpap1Q80TE0 1409 aa20.77■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Fyco1Q8VDC1 1437 aa20.77■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Erich3F6QRE9 1637 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa20.76■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.75■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Arap1Q4LDD4 1452 aa20.73■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Abca5Q8K448 1642 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Abcc2Q8VI47 1543 aa20.72■□□□□ 0.91
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Arhgap27A2AB59 869 aa20.7■□□□□ 0.9
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Pcf11G3X9Z4 1553 aa20.68■□□□□ 0.9
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Soga1E1U8D0 1418 aa20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Lmo7E9PYF4 1699 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa20.64■□□□□ 0.89
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.63■□□□□ 0.89
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Phf23Q8BSN5 401 aa20.62■□□□□ 0.89
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Map3k4O08648 1597 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Aebp1Q640N1 1128 aa20.6■□□□□ 0.89
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Dnmt1P13864 1620 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 AknaQ80VW7 1404 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Shroom2A2ALU4 1481 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 BlmO88700 1416 aa20.57■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 BC005561E9Q5E2 1589 aa20.56■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 WrnO09053 1401 aa20.55■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Neo1P97798 1493 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Slx4Q6P1D7 1565 aa20.53■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Tiam1Q60610 1591 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 CntlnA2AM05 1397 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Naip1Q9QWK5 1403 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Plppr3Q7TPB0 716 aa20.47■□□□□ 0.87
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Kif27Q7M6Z4 1394 aa20.45■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Abcc1O35379 1528 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Peg3Q3URU2 1571 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Lmod2Q3UHZ5 550 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Chd1P40201 1711 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Jph4Q80WT0 628 aa20.39■□□□□ 0.86
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Arhgef12Q8R4H2 1543 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa20.38■□□□□ 0.85
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 UbtfP25976 765 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gm14025A2AP89 1413 aa20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Rapgef6Q5NCJ1 1609 aa20.37■□□□□ 0.85
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Arhgap31A6X8Z5 1425 aa20.35■□□□□ 0.85
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Rrbp1Q99PL5 1605 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ccdc141E9Q8Q6 1531 aa20.32■□□□□ 0.84
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Arhgef11Q68FM7 1552 aa20.27■□□□□ 0.84
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ncoa2Q61026 1462 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Mroh2aD3Z750 1679 aa20.26■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ncoa3O09000 1398 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Mug1P28665 1476 aa20.24■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 NexmifQ5DTT1 1515 aa20.21■□□□□ 0.83
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Cep170Q6A065 1588 aa20.2■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 PtprtQ99M80 1454 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Magi1Q6RHR9 1471 aa20.19■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Kdm5bQ80Y84 1544 aa20.16■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Cdc42bpaQ3UU96 1719 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gcc2Q8CHG3 1679 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Prex2Q3LAC4 1598 aa20.15■□□□□ 0.82
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ccnb3Q810T2 1396 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Cul7Q8VE73 1689 aa20.14■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Kiaa1551Q5DTW7 1521 aa20.13■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Fancd2Q80V62 1450 aa20.12■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Dhx57Q6P5D3 1388 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 NhsB1AV60 1647 aa20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Fam163aQ8CAA5 168 aa20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Mapkbp1Q6NS57 1503 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Col17a1Q07563 1470 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa20.07■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Mier1Q5UAK0 511 aa20.06■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Gm156Q58A37 223 aa20.05■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Dnajc5P60904 198 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 AI481877A2ALV5 1481 aa20.04■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Igf1rQ60751 1373 aa20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10-201ENSMUST00000061745 Znf608Q56A10 1511 aa20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.7 ms