RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CrebzfQ91ZR3 358 aa15.2■□□□□ 0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pde4dQ01063 747 aa15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Map3k10Q66L42 940 aa15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb7bQ64321 544 aa15.16■□□□□ 0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Repin1Q5U4E2 545 aa15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf710Q3U288 666 aa15.11■□□□□ 0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam117bQ3U3E2 584 aa15.11■□□□□ 0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm13697A2AK42 830 aa15.08■□□□□ 0
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atad2Q8CDM1 1040 aa15.07■□□□□ 0
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Baz1aO88379 1555 aa15.07■□□□□ 0
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Crybg2B7ZCC2 1516 aa14.97□□□□□ -0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Spock2Q9ER58 423 aa14.97□□□□□ -0.01
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ercc6F8VPZ5 1481 aa14.91□□□□□ -0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fxr2Q9WVR4 673 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TMEM121BQ99MX7 572 aa14.88□□□□□ -0.03
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa14.87□□□□□ -0.03
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 OsbpQ3B7Z2 805 aa14.81□□□□□ -0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc180J3QNE4 1664 aa14.81□□□□□ -0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Chrm1P12657 460 aa14.8□□□□□ -0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ppp6r1Q7TSI3 856 aa14.79□□□□□ -0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Smarca2Q6DIC0 1577 aa14.78□□□□□ -0.04
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Evx2P49749 475 aa14.77□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa14.76□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Arhgef1Q61210 920 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ferd3lQ923Z4 168 aa14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa14.74□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ndufv2Q9D6J6 248 aa14.73□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa14.72□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf516Q7TSH3 1157 aa14.71□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tulp1Q9Z273 543 aa14.71□□□□□ -0.05
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf579Q80VM4 562 aa14.69□□□□□ -0.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam135aQ6NS59 1506 aa14.68□□□□□ -0.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa14.68□□□□□ -0.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dmrta2A2A9A2 531 aa14.67□□□□□ -0.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ubl4bQ9CQ84 188 aa14.66□□□□□ -0.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa14.64□□□□□ -0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Frmpd1A2AKB4 1549 aa14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wdr62Q3U3T8 1523 aa14.61□□□□□ -0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TimelessQ9R1X4 1197 aa14.6□□□□□ -0.07
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prim1P20664 417 aa14.56□□□□□ -0.08
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pcdhb17Q91VD8 799 aa14.55□□□□□ -0.08
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kank4Q6P9J5 1016 aa14.54□□□□□ -0.08
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa14.53□□□□□ -0.08
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pak3Q61036 559 aa14.49□□□□□ -0.09
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 ZxdbA2CE44 873 aa14.47□□□□□ -0.09
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mrc2Q64449 1479 aa14.44□□□□□ -0.1
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 C1qbpO35658 278 aa14.43□□□□□ -0.1
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Jph4Q80WT0 628 aa14.43□□□□□ -0.1
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Baz1bQ9Z277 1479 aa14.43□□□□□ -0.1
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa14.39□□□□□ -0.11
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Stk3Q9JI10 497 aa14.35□□□□□ -0.11
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CftrP26361 1476 aa14.32□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rsph6aQ8CDR2 708 aa14.31□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf225Q9D7D1 332 aa14.31□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dnajc5P60904 198 aa14.29□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Evi5P97366 809 aa14.28□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Synj1Q8CHC4 1574 aa14.27□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rgl2Q61193 778 aa14.25□□□□□ -0.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 E9Q0B3 247 aa14.24□□□□□ -0.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dcbld2Q91ZV3 769 aa14.24□□□□□ -0.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Unc13aQ4KUS2 1712 aa14.24□□□□□ -0.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa14.23□□□□□ -0.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam181bQ80VF6 417 aa14.21□□□□□ -0.13
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CatipB9EKE5 520 aa14.2□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cux2P70298 1426 aa14.17□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lhx8O35652 367 aa14.17□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Actn4P57780 912 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fndc3aQ8BX90 1198 aa14.17□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc24a1Q91WD8 1130 aa14.17□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Kif15Q6P9L6 1387 aa14.17□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nap1l5Q9JJF0 156 aa14.16□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Stk24Q99KH8 431 aa14.15□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Scnn1bQ9WU38 638 aa14.15□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Stk25Q9Z2W1 426 aa14.15□□□□□ -0.14
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mier1Q5UAK0 511 aa14.12□□□□□ -0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 UncxO08934 530 aa14.11□□□□□ -0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fkbp4P30416 458 aa14.11□□□□□ -0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cypt1Q8CH20 168 aa14.1□□□□□ -0.15
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa14.07□□□□□ -0.16
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa14.06□□□□□ -0.16
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rtl1Q7M732 1744 aa14.04□□□□□ -0.16
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tox2A2A472 547 aa14.01□□□□□ -0.17
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 St18Q80TY4 1045 aa14.01□□□□□ -0.17
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Il27Q8K3I6 234 aa14.01□□□□□ -0.17
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ankrd65F6YK91 380 aa14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.3 ms