RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627212.2

RAPGEF6-215, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,694 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-215ENST00000627212 UBE2BP63146 152 aa7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 NFE4Q86UQ8 179 aa7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 GPHB5Q86YW7 130 aa7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 C20orf173Q96LM9 149 aa7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.54□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 MUC4Q99102 2169 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 LMO4P61968 165 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 KLK12Q9UKR0 248 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A0B4J2C4 111 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A0J9YXY3 114 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 H0YGX0 51 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 PROK1P58294 105 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 RBX1P62877 108 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZTI0 123 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRM2P04554 102 aa7.52□□□□□ -1.2
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RAPGEF6-215ENST00000627212 K7EMT4 169 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 CRYGBP07316 175 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00574Q9H8X3 128 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ACYP1P07311 99 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 DEFB113Q30KQ7 82 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV2-11P01706 119 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 C16orf74Q96GX8 76 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 C19orf84I3L1E1 186 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 RNF185Q96GF1 192 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 H3BT86 120 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 C5orf47Q569G3 176 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 TM2D2Q9BX73 214 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 MYCNOSP40205 109 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM131Q92545 1883 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 NDUFS5O43920 106 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 SLPIP03973 132 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPAG11BQ08648 103 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ODF3BA8MYP8 253 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 PSMB8P28062 276 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 INSL3P51460 131 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 A6NDX4 124 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 MED14OSP0DP75 135 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.49□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 J3QKU1 62 aa7.49□□□□□ -1.21
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RAPGEF6-215ENST00000627212 MIAQ16674 131 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 ATOX1O00244 68 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q8N976 141 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 NREPQ16612 68 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 USP24Q9UPU5 2620 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRR9Q5T870 116 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPATA25Q9BR10 227 aa7.48□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.47□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 RNF152Q8N8N0 203 aa7.47□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 TRIAP1O43715 76 aa7.47□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.47□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 HIGD2BQ4VC39 106 aa7.46□□□□□ -1.21
RAPGEF6-215ENST00000627212 K7EQG2 157 aa7.46□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.46□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 Q6ZS46 218 aa7.46□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 SCXQ7RTU7 201 aa7.45□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.45□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.45□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 M0QY20 66 aa7.45□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 C20orf197Q8N268 126 aa7.45□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.44□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 NDUFA1O15239 70 aa7.44□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 LY6LH3BQJ8 138 aa7.44□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 TMEM258P61165 79 aa7.44□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.44□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.44□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 LINC00643Q86TS7 51 aa7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 NRACQ8N912 160 aa7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 PRO0255Q9UI72 69 aa7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.43□□□□□ -1.22
RAPGEF6-215ENST00000627212 A0A096LNI7 61 aa7.43□□□□□ -1.22
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