RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625713.2

ARRDC3-AS1-201, ARRDC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ARRDC3-AS1, Length 2,500 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.18□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TIRAPP58753 221 aa9.18□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GAGE12JA6NER3 117 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GAGE7O76087 117 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GAGE12FP0CL80 117 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GAGE12GP0CL81 117 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GAGE12IP0CL82 117 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GAGE4Q13068 117 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 C10orf99Q6UWK7 81 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NDUFA1O15239 70 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZNF415Q09FC8 603 aa9.17□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 AVPP01185 164 aa9.16□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CLEC2BQ92478 149 aa9.16□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.16□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 B4DSR2 109 aa9.16□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 B5MCH6 92 aa9.16□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGHV4-59P01825 116 aa9.16□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 KNCNA6PVL3 124 aa9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 A8MZ25 164 aa9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ATP5J2P56134 94 aa9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DUX3Q96PT4 197 aa9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 Q6ZSN1 163 aa9.15□□□□□ -0.94
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGHV3-53P01767 116 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NPC2P61916 151 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DEFB112Q30KQ8 113 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 Q6ZSV7 163 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HTN1P15515 57 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DUX5Q96PT3 197 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRORYQ9H606 182 aa9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DEFB131AP59861 70 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TMEM101Q96IK0 257 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 UBE2E2Q96LR5 201 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CCDC179H3BU77 68 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 GNLYP22749 145 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LY6DQ14210 128 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 Q9UF83 564 aa9.13□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 COPS9Q8WXC6 57 aa9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 RS1O15537 224 aa9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ACYP1P07311 99 aa9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.12□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.11□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SPTA1P02549 2419 aa9.11□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HERVK_113P63121 156 aa9.11□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.11□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 COX7A2LO14548 114 aa9.1□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DSCR9P59020 149 aa9.1□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa9.1□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.09□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DAND5Q8N907 189 aa9.09□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LINC01587Q99440 93 aa9.09□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PPDPFQ9H3Y8 114 aa9.09□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 Q9H8V8 135 aa9.09□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.09□□□□□ -0.95
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 J3QLI3 93 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PRM2P04554 102 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 COX6A2Q02221 97 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 IMUPQ9GZP8 106 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZNF702PQ9H963 129 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NACAE9PAV3 2078 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 VPREB3Q9UKI3 123 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.08□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.07□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 INSP01308 110 aa9.07□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 TRACP01848 142 aa9.07□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SLURP1P55000 103 aa9.06□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.06□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 PEMTQ9UBM1 199 aa9.06□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MUC6Q6W4X9 2439 aa9.06□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.06□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 HERV-K104P63124 156 aa9.05□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.05□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 NBASA2RRP1 2371 aa9.05□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 Q6YL49 198 aa9.04□□□□□ -0.96
ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms