RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621456.2

SLC38A3-208, Transcript of solute carrier family 38 member 3, human

TSL 5

Gene SLC38A3, Length 635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC38A3-208	ENST00000621456	UBE2L6	O14933	153 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	HAMP	P81172	84 aa		11.52	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456		A0A1B0GVG6	124 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	AMT	P48728	403 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	REG3A	Q06141	175 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	LINC01551	Q86U37	167 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	GATD1	Q8NB37	220 aa		11.51	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	USP17L23	D6RBM5	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.5	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM231B	A6NCW3	169 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	TSKU	Q8WUA8	353 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.49	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456		A0A1B0GUT8	65 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	HIGD1C	A8MV81	97 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	NCR2	O95944	276 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	MYCBP2	O75592	4640 aa		11.48	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	LINC01620	Q4KN68	170 aa		11.47	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.46	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
SLC38A3-208	ENST00000621456	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	APCS	P02743	223 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.45	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456		H7C423	109 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	PRSS1	P07477	247 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		11.44	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	SCX	Q7RTU7	201 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	HERC1	Q15751	4861 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456		I3L3M4	83 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	PMCH	P20382	165 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	RIG	Q13278	110 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	PEA15	Q15121	130 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	ISOC2	Q96AB3	205 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	MRAP2	Q96G30	205 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456		V9GYV3	84 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	ST20	Q9HBF5	79 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	NAT8	Q9UHE5	227 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	ADIRF	Q15847	76 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	NUP35	Q8NFH5	326 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SLC38A3-208	ENST00000621456	hDV102S1	A0JD36	115 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	PPP1R17	O96001	155 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	FGF6	P10767	208 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	RAB4A	P20338	218 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	BTF3L4	Q96K17	158 aa		11.38	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	AMN1	Q8IY45	258 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.37	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456		C9JQL5	133 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456		A0A1B0GW15	77 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	GAS8-AS1	O95177	125 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	TSHB	P01222	138 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	VCY	O14598	125 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	ESD	P10768	282 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SLC38A3-208	ENST00000621456	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	PPP1R2P9	O14990	202 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	S100A8	P05109	93 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	FCER1G	P30273	86 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SLC38A3-208	ENST00000621456	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6

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