RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00694P0DN24 101 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2D3P61077 147 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LMO4P61968 165 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf85Q96MD7 179 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 IGF1P05019 195 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.56□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 CCDC140Q96MF4 163 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf86A6NJI1 115 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 NUPR1O60356 82 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 C20orf197Q8N268 126 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 UPK3BQ9BT76 320 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZSV7 163 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 BPY2O14599 106 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 FXYD2P54710 66 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 MLST8Q9BVC4 326 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.55□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFA7O95182 113 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 MED13Q9UHV7 2174 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 USP17L23D6RBM5 183 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 VPREB1P12018 145 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 MIFP14174 115 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa6.54□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 MSMPQ1L6U9 139 aa6.53□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0J9YWU9 116 aa6.53□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 E9PLD3 99 aa6.53□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.53□□□□□ -1.36
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 TIMM17BO60830 172 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 DCANP1Q8TF63 244 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 CTRLP40313 264 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLC6P0CF74 106 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ODF1Q14990 250 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SCXQ7RTU7 201 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ODF3BA8MYP8 253 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 K7ERS5 55 aa6.52□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 TNCP24821 2201 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV2D-28P01615 120 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM131Q92545 1883 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SYCNQ0VAF6 134 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SPRY4Q9C004 299 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PMAIP1Q13794 54 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 NOTCH4Q99466 2003 aa6.51□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00643Q86TS7 51 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 LY6LH3BQJ8 138 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PDE6GP18545 87 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 MIAQ16674 131 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SLPIP03973 132 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PLA2G2AP14555 144 aa6.5□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EQG2 157 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2D2P62837 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 CREBBPQ92793 2442 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV2-14P01704 120 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.49□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 H7C423 109 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 SMR3AQ99954 134 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 ODF3Q96PU9 254 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 NUPR2A6NF83 97 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N976 141 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PROK1P58294 105 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC01006Q8NI28 216 aa6.48□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.47□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.47□□□□□ -1.37
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0J9YXY3 114 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 156.5 ms