RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	DEFB130A	P0DP74	79 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	LHB	P01229	141 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MBD6	Q96DN6	1003 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MBD3L4	A6NDZ8	208 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MBD3L3	A6NE82	208 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	MBD3L5	A6NJ08	208 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	FHL1	Q13642	323 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00208	Q96KT6	92 aa		5.48	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ATP6V0E1	O15342	81 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	DEFB131A	P59861	70 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459		A0A087WZ39	114 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	HCG22	E2RYF7	251 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	EFNA2	O43921	213 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.46	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		5.46	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	RNF144B	Q7Z419	303 aa		5.46	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		5.46	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV3-53	P01767	116 aa		5.46	□□□□□ -1.53
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	HILS1	P60008	231 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	SPRY2	O43597	315 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		A0A087WV48	116 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		K7EIM0	57 aa		5.46	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		I3L2K1	104 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	NCR3	O14931	201 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	SAA4	P35542	130 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	LYPD6	Q86Y78	171 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	SORL1	Q92673	2214 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	CLPS	P04118	112 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		Q9HAA7	133 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	CRYGD	P07320	174 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		P0C879	139 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		A8MZ25	164 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	DKK4	Q9UBT3	224 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	LY6H	O94772	140 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		M0R378	163 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	GYPE	P15421	78 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	CCL18	P55774	89 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZR03	302 aa		5.43	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	DSCAM	O60469	2012 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		A0A087WW49	117 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZVQ6	151 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGKV1-17	P01599	117 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGF1	P05019	195 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	FSTL3	O95633	263 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	CTSG	P08311	255 aa		5.42	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		Q6ZQY7	126 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	PLA2G5	P39877	138 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGLV1-44	P01699	117 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.41	□□□□□ -1.54
MDM4-215	ENST00000614459		E7EQL1	145 aa		5.41	□□□□□ -1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms