RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q9UF83 564 aa6.34□□□□□ -1.39
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 GAGE1Q13065 139 aa6.33□□□□□ -1.4
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GAGE4Q13068 117 aa6.33□□□□□ -1.4
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GAGE5Q13069 117 aa6.33□□□□□ -1.4
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GAGE13Q4V321 117 aa6.33□□□□□ -1.4
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.31□□□□□ -1.4
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TMEM141Q96I45 108 aa6.31□□□□□ -1.4
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa6.28□□□□□ -1.4
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
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NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 F8VRH5 84 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRSS1P07477 247 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PMVKQ15126 192 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 VAMP8Q9BV40 100 aa6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A096LPF7 62 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A0J9YY99 117 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLNP26678 52 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TIRAPP58753 221 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 Q6ZUT4 128 aa6.26□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.25□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.25□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UBE2L6O14933 153 aa6.25□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DPM2O94777 84 aa6.25□□□□□ -1.41
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FGF6P10767 208 aa6.25□□□□□ -1.41
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