RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 I3L3M4 83 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCL24O00175 119 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRTAP1-1Q07627 177 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEX29Q8N6K0 151 aa15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XCL2Q9UBD3 114 aa15.87■□□□□ 0.13
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPAN13O95857 204 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDZD2O15018 2839 aa15.86■□□□□ 0.13
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A6NJY4 79 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 M0R2P5 195 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FHL3Q13643 280 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTH2Q96A98 100 aa15.86■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa15.85■□□□□ 0.13
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6ZSN1 163 aa15.85■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNRF2Q8NHG8 242 aa15.85■□□□□ 0.13
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MT-ATP8P03928 68 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPINK8P0C7L1 97 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2D1P51668 147 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WNK1Q9H4A3 2382 aa15.84■□□□□ 0.13
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C20orf203Q8NBC4 194 aa15.83■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INSP01308 110 aa15.83■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLA2G2AP14555 144 aa15.83■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STHQ8IWL8 128 aa15.82■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C11orf72Q8NBR9 251 aa15.82■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP15.81■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A8MWV9 139 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRYBA4P53673 196 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC01006Q8NI28 216 aa15.81■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HERVK_113P61574 105 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITPR2Q14571 2701 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 XGP55808 180 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2D3P61077 147 aa15.8■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 UBE2D2P62837 147 aa15.8■□□□□ 0.12
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 Q6ZUT4 128 aa15.79■□□□□ 0.12
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.79■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTORP42345 2549 aa15.78■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCL1BO95988 128 aa15.77■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.77■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPDPFLQ8WWR9 84 aa15.77■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa15.76■□□□□ 0.11
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TEN1Q86WV5 123 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VCX2Q9H322 139 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAV25A0A0B4J276 109 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C1orf158Q8N1D5 194 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0J9YXV3 536 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0J9YY99 117 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SVIPQ8NHG7 77 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LYRM7Q5U5X0 104 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMR3AQ99954 134 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EDA2RQ9HAV5 297 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WFDC10AQ9H1F0 79 aa15.73■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPXQ9BT56 116 aa15.73■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LINC00467Q9BRT7 94 aa15.72■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFC1BP0CG36 223 aa15.72■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CFC1P0CG37 223 aa15.72■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa15.71■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 J3QQQ9 107 aa15.71■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa15.71■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3-30P01768 117 aa15.71■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.71■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BEAN1Q3B7T3 259 aa15.71■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM104AQ969W3 186 aa15.71■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RHODO00212 210 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD29Q8N6D5 301 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NACAE9PAV3 2078 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGHV3-53P01767 116 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C16orf95Q9H693 158 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM223A0PJW6 202 aa15.69■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RS1O15537 224 aa15.69■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCGB1C2P0DMR2 95 aa15.69■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF183Q96D59 192 aa15.69■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CHCHD7Q9BUK0 85 aa15.69■□□□□ 0.1
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