RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0J9YY99 117 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01549A6NIU2 74 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BMG7 143 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VCX2Q9H322 139 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM104AQ969W3 186 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3QQQ9 107 aa8.57□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 K7ERU9 68 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCL24O00175 119 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOMO95445 188 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF415Q09FC8 603 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMELXQ99217 191 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VWFP04275 2813 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MWV9 139 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RRN3P1Q2M238 152 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.56□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1B0GWB2 263 aa8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC2Q14508 124 aa8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NFE4Q86UQ8 179 aa8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPXQ9BT56 116 aa8.55□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 INSP01308 110 aa8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STHQ8IWL8 128 aa8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM223A0PJW6 202 aa8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM86BQ8N661 226 aa8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.54□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RHODO00212 210 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FHL3Q13643 280 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01006Q8NI28 216 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.53□□□□□ -1.04
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-53P01767 116 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-30P01768 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2D1P51668 147 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A8MZ25 164 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.52□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.51□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.51□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 G3V4G9 280 aa8.51□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.51□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A6NJY4 79 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LEPROTO15243 131 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN13O95857 204 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFC1BP0CG36 223 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFC1P0CG37 223 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BEAN1Q3B7T3 259 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETDBQ3ZM63 59 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZTI0 123 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZUT4 128 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMR3AQ99954 134 aa8.5□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RS1O15537 224 aa8.49□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2G2AP14555 144 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A4D1N5 150 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINK8P0C7L1 97 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GAGE13Q4V321 117 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.48□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F8W1H4 67 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSMB2P49721 201 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H7C2G1 150 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRO0461Q9UI25 63 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM238C9JI98 176 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NDUFA7O95182 113 aa8.47□□□□□ -1.05
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CFAP161Q6P656 301 aa8.47□□□□□ -1.05
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