RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1W2PPM0 123 aa13.46□□□□□ -0.26
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.44□□□□□ -0.26
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 COTL1Q14019 142 aa13.44□□□□□ -0.26
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.44□□□□□ -0.26
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 A6NJY4 79 aa13.41□□□□□ -0.26
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPCS1Q9Y6A9 102 aa13.41□□□□□ -0.26
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 C16orf74Q96GX8 76 aa13.4□□□□□ -0.26
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 RRN3P1Q2M238 152 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TIMM21Q9BVV7 248 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa13.35□□□□□ -0.27
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00482Q8N8I6 264 aa13.35□□□□□ -0.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.33□□□□□ -0.27
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2D1P51668 147 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INAFM1C9JVW0 142 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE7O76087 117 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-30P01768 117 aa13.3□□□□□ -0.28
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HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE12GP0CL81 117 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE12IP0CL82 117 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOSL1P15407 271 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2D3P61077 147 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBE2D2P62837 147 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 INSL3P51460 131 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE12JA6NER3 117 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE4Q13068 117 aa13.28□□□□□ -0.28
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