RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599236.5

FCHO1-228, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-228ENST00000599236 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 SULT1A2P50226 295 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 RASL11AQ6T310 242 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.73□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 NIT2Q9NQR4 276 aa8.72□□□□□ -1.01
FCHO1-228ENST00000599236 CFAP161Q6P656 301 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.71□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 AMTP48728 403 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 CCL20P78556 96 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 FOXI1Q12951 378 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.7□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 SMLR1H3BR10 107 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 H7C1H1 209 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 UBE2L6O14933 153 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 ARPC5O15511 151 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 REG3GQ6UW15 175 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 Q6ZNX1 250 aa8.69□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 RAB19A4D1S5 217 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 NTF3P20783 257 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 COTL1Q14019 142 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 GATD1Q8NB37 220 aa8.68□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 CACNG7P62955 275 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.67□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 A0A1W2PNN7 141 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 PFDN1O60925 122 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 CENPWQ5EE01 88 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 Q6ZRP5 223 aa8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 XCL1P47992 114 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 C11orf52Q96A22 123 aa8.65□□□□□ -1.02
FCHO1-228ENST00000599236 FAM231BA6NCW3 169 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 FGF6P10767 208 aa8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 F2Z2F3 143 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.63□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 CCL25O15444 150 aa8.62□□□□□ -1.03
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FCHO1-228ENST00000599236 TRGC1P0CF51 173 aa8.62□□□□□ -1.03
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FCHO1-228ENST00000599236 GNG13Q9P2W3 67 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.62□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 UMAD1C9J7I0 102 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 PTTG1IPP53801 180 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 TWIST1Q15672 202 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 NUDT11Q96G61 164 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.61□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 CTRLP40313 264 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 SYCNQ0VAF6 134 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 GAGE2BQ13066 116 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.6□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 CNFNQ9BYD5 112 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.59□□□□□ -1.03
FCHO1-228ENST00000599236 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 H7C423 109 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 NCR2O95944 276 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 APCSP02743 223 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 BCL2P10415 239 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 ESDP10768 282 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 GNG4P50150 75 aa8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.57□□□□□ -1.04
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FCHO1-228ENST00000599236 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.57□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 XKRY2A2RUG3 117 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 K7EN84 100 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 TSHBP01222 138 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 MANBALQ9NQG1 85 aa8.56□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 MT-ND6P03923 174 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 PMCHP20382 165 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 CAMPP49913 170 aa8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
FCHO1-228ENST00000599236 ZNF345Q14585 488 aa8.55□□□□□ -1.04
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