RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 LYPD6Q86Y78 171 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 Q8IYB0 196 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 DYNAPQ8N1N2 210 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
PTPRM-204ENST00000577468 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 PCNX2A6NKB5 2137 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 PLXNB2O15031 1838 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 MYO9BQ13459 2157 aa2.08□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 TMEM14DPA8MWL7 114 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 B4DSR2 109 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 H7C423 109 aa2.08□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 CFC1P0CG37 223 aa2.08□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 PLNP26678 52 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf66Q5T8R8 295 aa2.08□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf134Q5TEV5 83 aa2.08□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.08□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.07□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 ROMO1P60602 79 aa2.07□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.06□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 Q8NDZ9 215 aa2.06□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 MPDZO75970 2070 aa2.06□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 ARID1AO14497 2285 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa2.05□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa2.05□□□□□ -2.08
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PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 UBALD1Q8TB05 177 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 SNURFQ9Y675 71 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 LHFPL6Q9Y693 200 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 PCNTO95613 3336 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF407Q9C0G0 2248 aa2.05□□□□□ -2.08
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa2.04□□□□□ -2.08
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