RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-226	ENST00000570051	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	HERC2	O95714	4834 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	ADCYAP1	P18509	176 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051		Q0VG73	95 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051		A0A1B0GXF2	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	NCR2	O95944	276 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	CRP	P02741	224 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	HBB	P68871	147 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	ST20	Q9HBF5	79 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RNPS1-226	ENST00000570051	TMEM218	A2RU14	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	SMKR1	H3BMG3	65 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	MT-ND4L	P03901	98 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	WFDC2	Q14508	124 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	PRR34	Q9NV39	138 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051		A0A1B0GUV1	79 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051		I3L3M4	83 aa		13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	UBE2L6	O14933	153 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	APCS	P02743	223 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	S100A8	P05109	93 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	COMMD7	Q86VX2	200 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051		Q8N814	137 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	NRAC	Q8N912	160 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		13.68	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051		F8W036	122 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	PMCH	P20382	165 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	MIA	Q16674	131 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		13.67	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	PPP1R17	O96001	155 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	TSHB	P01222	138 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.66	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	RYR1	P21817	5038 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	LINC00862	A6NCI5	91 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	LECT2	O14960	151 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	SEC11C	Q9BY50	192 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		13.65	□□□□□ -0.22
RNPS1-226	ENST00000570051	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	REG3A	Q06141	175 aa		13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051		H7C423	109 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	CDK2AP2	O75956	126 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	CKS2	P33552	79 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	ESD	P10768	282 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051		D6R8Y8	96 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	VCY	O14598	125 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	FGF6	P10767	208 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	C20orf78	Q9BR46	151 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	HSPG2	P98160	4391 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	TNFRSF6B	O95407	300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	BTF3L4	Q96K17	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	IMMP2L	Q96T52	175 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-226	ENST00000570051	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	PPBP	P02775	128 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	GCSH	P23434	173 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	NPY	P01303	97 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	FCER1G	P30273	86 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	KIR2DL4	Q99706	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	PHOX2A	O14813	284 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	ORMDL3	Q8N138	153 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	USP17L23	D6RBM5	183 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	C14orf177	Q52M58	125 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	TMEM101	Q96IK0	257 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	PRELID3A	Q96N28	172 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-226	ENST00000570051	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-226	ENST00000570051	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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