RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 M0R2P5 195 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZSN1 163 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N2B8 174 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RAX2Q96IS3 184 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MTORP42345 2549 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF415Q09FC8 603 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ETDBQ3ZM63 59 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE13Q4V321 117 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XCL2Q9UBD3 114 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JMJD1CQ15652 2540 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F8W1H4 67 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NFE4Q86UQ8 179 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPXQ9BT56 116 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AKAP9Q99996 3911 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A8MWV9 139 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZSV7 163 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM223A0PJW6 202 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RHODO00212 210 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2D1P51668 147 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSPAN13O95857 204 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-30P01768 117 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AMELXQ99217 191 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PSMB2P49721 201 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LEPROTO15243 131 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 INSP01308 110 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A8MTW9 85 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFC1BP0CG36 223 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CFC1P0CG37 223 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HERV-K104P63124 156 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 STHQ8IWL8 128 aa9.01□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa9.01□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.01□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H7C2G1 150 aa9□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ODF3L2Q3SX64 289 aa9□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM104AQ969W3 186 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRO0461Q9UI25 63 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A4D1N5 150 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ESM1Q9NQ30 184 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCL24O00175 119 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGHV3-53P01767 116 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A8MZ25 164 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 INSL3P51460 131 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZUT4 128 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.98□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 J3QR89 54 aa8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRSS2P07478 247 aa8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPINK8P0C7L1 97 aa8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM86BQ8N661 226 aa8.97□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A0J9YXY3 114 aa8.96□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2D3P61077 147 aa8.96□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UBE2D2P62837 147 aa8.96□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.96□□□□□ -0.97
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TCL1BO95988 128 aa8.96□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.96□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.96□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RS1O15537 224 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPC2P61916 151 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTH2Q96A98 100 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms