RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TBPP20226 339 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RANP62826 216 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PDE6HQ13956 83 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 GCSAMLQ5JQS6 135 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 DAND5Q8N907 189 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 HYLS1Q96M11 299 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 AQP10Q96PS8 301 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 KIR2DL4Q99706 377 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 SLC25A2Q9BXI2 301 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 TREM1Q9NP99 234 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 CACFD1Q9UGQ2 172 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 PRO0461Q9UI25 63 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 LENEPQ9Y5L5 61 aa2.34□□□□□ -2.03
TMOD3-210ENST00000561408 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0B4J2A0 478 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 H3BVH4 76 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 M0QXV9 152 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 APOMO95445 188 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CSN1S1P47710 185 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 XCL1P47992 114 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP10-10P60014 251 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 GNGT1P63211 74 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 NUP35Q8NFH5 326 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 MITD1Q8WV92 249 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 NMES1Q9C002 83 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 PSENENQ9NZ42 101 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM14CQ9P0S9 112 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SHPKQ9UHJ6 478 aa2.33□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV6A0A075B6T7 132 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 M0R381 172 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 MED6O75586 246 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF56Q15929 161 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 IQCJQ1A5X6 159 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2NLQ5JXB2 153 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 MIR17HGQ75NE6 70 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 OR1L4Q8NGR5 311 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SFRP2Q96HF1 295 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 RABL2BQ9UNT1 228 aa2.32□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 H3BMQ9 156 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TSC22D2O75157 780 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CIB2O75838 187 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 GCGP01275 180 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 ARMS2P0C7Q2 107 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TGFBR1P36897 503 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 DEFA3P59666 94 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 GNG5P63218 68 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 OR5A1Q8NGJ0 315 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 FXYD5Q96DB9 178 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 VCX2Q9H322 139 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SCN3BQ9NY72 215 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 PSG8Q9UQ74 426 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa2.31□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 C9orf92A6NGG3 77 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CCL25O15444 150 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 SSSCA1O60232 199 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 RAB3DO95716 219 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CXCL6P80162 114 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 PFDN5Q99471 154 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM243Q9BU79 118 aa2.3□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 E9PLD3 99 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 FNDC10F2Z333 226 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 M0R036 132 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TAS2R19P59542 299 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 RAB4BP61018 213 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 CTAG1AP78358 180 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 Q1RN00 199 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM97Q5BJF2 176 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 ZFP1Q6P2D0 407 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 C2orf66Q6UXQ4 117 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 ISOC2Q96AB3 205 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 IL36BQ9NZH7 164 aa2.29□□□□□ -2.04
TMOD3-210ENST00000561408 OR5AC2Q9NZP5 309 aa2.29□□□□□ -2.04
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