RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	MIF	P14174	115 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	EVI2A	P22794	236 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZTI0	123 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	C16orf74	Q96GX8	76 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	BTF3L4	Q96K17	158 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	B9D2	Q9BPU9	175 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	CNFN	Q9BYD5	112 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	NOTCH1	P46531	2555 aa		3.05	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GXF2	115 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934		E9PLD3	99 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	CRYGD	P07320	174 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB130B	P0DP73	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	DEFB130A	P0DP74	79 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	S100P	P25815	95 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	LINC00315	P59091	139 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	CACNG7	P62955	275 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	ZFP82	Q8N141	532 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	PTH2	Q96A98	100 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		3.04	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	RS1	O15537	224 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	RAB4A	P20338	218 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	RAB4B	P61018	213 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	RAB5B	P61020	215 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	C12orf74	Q32Q52	190 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	FAM104B	Q5XKR9	115 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	CEND1	Q8N111	149 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	GATD1	Q8NB37	220 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	BORCS7	Q96B45	105 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		3.03	□□□□□ -1.92
LINS1-210	ENST00000560934	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934		A0A1B0GW15	77 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	LYRM9	A8MSI8	78 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934		A8MU10	97 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934		A8MWV9	139 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	TRGC2	P03986	189 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HBB	P68871	147 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	SLA	Q13239	276 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	RASL11A	Q6T310	242 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	FRZB	Q92765	325 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	C18orf15	Q96N68	181 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	NACA	E9PAV3	2078 aa		3.02	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934		F8WDY8	70 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934		M0QY20	66 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2BK	O60814	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	APCS	P02743	223 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	S100A8	P05109	93 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	MGP	P08493	103 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	TRGC1	P0CF51	173 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	SMIM17	P0DL12	118 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934		P0DMU3	169 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	FAM231A	P0DMU4	169 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	FAM231C	P0DMU5	169 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2BO	P23527	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2BB	P33778	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2BD	P58876	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	DAD1	P61803	113 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST1H2BC	P62807	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LINS1-210	ENST00000560934	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93

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