RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554102.5

SPATA7-208, Transcript of spermatogenesis associated 7, human

TSL 3

Gene SPATA7, Length 501 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA7-208	ENST00000554102	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		9.5	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	SMKR1	H3BMG3	65 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	TNFRSF6B	O95407	300 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	FCER1G	P30273	86 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	LAGE3	Q14657	143 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	PRELID3A	Q96N28	172 aa		9.49	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102		H7C423	109 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	NRAC	Q8N912	160 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	TMEM18	Q96B42	140 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	RMI2	Q96E14	147 aa		9.48	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	CRP	P02741	224 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102		Q0VG73	95 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		9.47	□□□□□ -0.89
SPATA7-208	ENST00000554102	RAB5A	P20339	215 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	GAGE6	Q13070	117 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	TM2D2	Q9BX73	214 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	COX11	Q9Y6N1	276 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		9.46	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102		A0A1B0GUV1	79 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	GAS8-AS1	O95177	125 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	NPY	P01303	97 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	ATRAID	Q6UW56	229 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	TMEM101	Q96IK0	257 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		9.45	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	PSCA	O43653	123 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	MPV17L2	Q567V2	206 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	KLK12	Q9UKR0	248 aa		9.44	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	PRSS47	A8MTI9	375 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	EREG	O14944	169 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	TSHB	P01222	138 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	RBX1	P62877	108 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		9.43	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	RYR2	Q92736	4967 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102		K7EMI3	77 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	G0S2	P27469	103 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	UBE2W	Q96B02	151 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102		Q9HAA7	133 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		9.42	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	RTL8C	O15255	209 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	ESD	P10768	282 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	MIA	Q16674	131 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		9.41	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	FGF6	P10767	208 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102		Q8N8P6	123 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102		Q8N976	141 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		9.4	□□□□□ -0.9
SPATA7-208	ENST00000554102	KMT2A	Q03164	3969 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102		Q8N3U1	123 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		9.39	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		9.38	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	REG3A	Q06141	175 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	PRR34	Q9NV39	138 aa		9.37	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	LINC01549	A6NIU2	74 aa		9.36	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	S100A1	P23297	94 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	RYR3	Q15413	4870 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	ENHO	Q6UWT2	76 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	FA2H	Q7L5A8	372 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	YPEL4	Q96NS1	127 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		9.35	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	RAB5B	P61020	215 aa		9.34	□□□□□ -0.91
SPATA7-208	ENST00000554102	TNP2	Q05952	138 aa		9.34	□□□□□ -0.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms