RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552915.5

CNOT2-241, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-241ENST00000552915 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 S100A6P06703 90 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 PMCHP20382 165 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 SMIM2Q9BVW6 85 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.51□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 NUDT3O95989 172 aa8.5□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TCAPO15273 167 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 FCER1GP30273 86 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 C20orf78Q9BR46 151 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 TENM3Q9P273 2699 aa8.49□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 SERF1AO75920 110 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 Q0VG73 95 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 NIT1Q86X76 327 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 Q8N8P6 123 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 KIR2DL4Q99706 377 aa8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 IGLL5B9A064 214 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 I3L3M4 83 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 VCYO14598 125 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 UBE2D3P61077 147 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 UBE2D2P62837 147 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.47□□□□□ -1.05
CNOT2-241ENST00000552915 HSBP1O75506 76 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00614P0C842 121 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 COTL1Q14019 142 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 PMCHL1Q16048 86 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.46□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 AMTP48728 403 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.45□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 PRSS47A8MTI9 375 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 NUPR1O60356 82 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 TSHBP01222 138 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 LAGE3Q14657 143 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 COL7A1Q02388 2944 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00694P0DN24 101 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 S100A2P29034 98 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.43□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 NUPR2A6NF83 97 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 H3BNG1 76 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.42□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 UBE2L6O14933 153 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 FABP4P15090 132 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 HBDP02042 147 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM243Q9BU79 118 aa8.4□□□□□ -1.06
CNOT2-241ENST00000552915 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 K7EMI3 77 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 GAGE6Q13070 117 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM18Q96B42 140 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 CYSLTR1Q9Y271 337 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 TGP01266 2768 aa8.39□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 LINC01546A6NGU7 62 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 C5orf52A6NGY3 159 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 MUC7Q8TAX7 377 aa8.38□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 A0A096LNJ9 63 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM262E9PQX1 116 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 H0Y8G0 127 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 LEPROTL1O95214 131 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 ESDP10768 282 aa8.37□□□□□ -1.07
CNOT2-241ENST00000552915 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.1 ms